Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y466

NR2E1, Nuclear receptor subfamily 2 group E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2E1Q9Y466 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
NR2E1Q9Y466 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
NR2E1Q9Y466 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
NR2E1Q9Y466 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
NR2E1Q9Y466 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
NR2E1Q9Y466 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
NR2E1Q9Y466 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
NR2E1Q9Y466 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NR2E1Q9Y466 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
NR2E1Q9Y466 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NR2E1Q9Y466 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NR2E1Q9Y466 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
NR2E1Q9Y466 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.12■■■□□ 2.57
NR2E1Q9Y466 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
NR2E1Q9Y466 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NR2E1Q9Y466 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
NR2E1Q9Y466 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
NR2E1Q9Y466 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
NR2E1Q9Y466 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
NR2E1Q9Y466 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NR2E1Q9Y466 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NR2E1Q9Y466 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NR2E1Q9Y466 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NR2E1Q9Y466 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NR2E1Q9Y466 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
NR2E1Q9Y466 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NR2E1Q9Y466 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NR2E1Q9Y466 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NR2E1Q9Y466 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NR2E1Q9Y466 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
NR2E1Q9Y466 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
NR2E1Q9Y466 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NR2E1Q9Y466 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
NR2E1Q9Y466 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
NR2E1Q9Y466 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
NR2E1Q9Y466 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
NR2E1Q9Y466 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NR2E1Q9Y466 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NR2E1Q9Y466 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NR2E1Q9Y466 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
NR2E1Q9Y466 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NR2E1Q9Y466 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
NR2E1Q9Y466 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
NR2E1Q9Y466 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
NR2E1Q9Y466 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
NR2E1Q9Y466 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NR2E1Q9Y466 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
NR2E1Q9Y466 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
NR2E1Q9Y466 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NR2E1Q9Y466 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
NR2E1Q9Y466 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
NR2E1Q9Y466 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
NR2E1Q9Y466 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
NR2E1Q9Y466 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
NR2E1Q9Y466 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NR2E1Q9Y466 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
NR2E1Q9Y466 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
NR2E1Q9Y466 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
NR2E1Q9Y466 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NR2E1Q9Y466 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NR2E1Q9Y466 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NR2E1Q9Y466 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
NR2E1Q9Y466 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
NR2E1Q9Y466 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NR2E1Q9Y466 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NR2E1Q9Y466 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NR2E1Q9Y466 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NR2E1Q9Y466 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NR2E1Q9Y466 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NR2E1Q9Y466 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NR2E1Q9Y466 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NR2E1Q9Y466 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
NR2E1Q9Y466 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NR2E1Q9Y466 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
NR2E1Q9Y466 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NR2E1Q9Y466 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NR2E1Q9Y466 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NR2E1Q9Y466 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NR2E1Q9Y466 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
NR2E1Q9Y466 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NR2E1Q9Y466 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
NR2E1Q9Y466 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NR2E1Q9Y466 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
NR2E1Q9Y466 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
NR2E1Q9Y466 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
NR2E1Q9Y466 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NR2E1Q9Y466 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NR2E1Q9Y466 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
NR2E1Q9Y466 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NR2E1Q9Y466 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NR2E1Q9Y466 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NR2E1Q9Y466 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NR2E1Q9Y466 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
NR2E1Q9Y466 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NR2E1Q9Y466 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NR2E1Q9Y466 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NR2E1Q9Y466 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NR2E1Q9Y466 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NR2E1Q9Y466 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NR2E1Q9Y466 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms