Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3R0

GRIP1, Glutamate receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIP1Q9Y3R0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GRIP1Q9Y3R0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRIP1Q9Y3R0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRIP1Q9Y3R0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRIP1Q9Y3R0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIP1Q9Y3R0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIP1Q9Y3R0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIP1Q9Y3R0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIP1Q9Y3R0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIP1Q9Y3R0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIP1Q9Y3R0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIP1Q9Y3R0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIP1Q9Y3R0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIP1Q9Y3R0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIP1Q9Y3R0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRIP1Q9Y3R0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
GRIP1Q9Y3R0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GRIP1Q9Y3R0 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIP1Q9Y3R0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIP1Q9Y3R0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
GRIP1Q9Y3R0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIP1Q9Y3R0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRIP1Q9Y3R0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRIP1Q9Y3R0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRIP1Q9Y3R0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRIP1Q9Y3R0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GRIP1Q9Y3R0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRIP1Q9Y3R0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRIP1Q9Y3R0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRIP1Q9Y3R0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIP1Q9Y3R0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIP1Q9Y3R0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIP1Q9Y3R0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIP1Q9Y3R0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIP1Q9Y3R0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIP1Q9Y3R0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIP1Q9Y3R0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIP1Q9Y3R0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIP1Q9Y3R0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIP1Q9Y3R0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIP1Q9Y3R0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIP1Q9Y3R0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIP1Q9Y3R0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIP1Q9Y3R0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIP1Q9Y3R0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIP1Q9Y3R0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIP1Q9Y3R0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIP1Q9Y3R0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GRIP1Q9Y3R0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GRIP1Q9Y3R0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GRIP1Q9Y3R0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIP1Q9Y3R0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIP1Q9Y3R0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIP1Q9Y3R0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIP1Q9Y3R0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIP1Q9Y3R0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIP1Q9Y3R0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIP1Q9Y3R0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIP1Q9Y3R0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIP1Q9Y3R0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIP1Q9Y3R0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIP1Q9Y3R0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIP1Q9Y3R0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIP1Q9Y3R0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIP1Q9Y3R0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIP1Q9Y3R0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIP1Q9Y3R0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIP1Q9Y3R0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIP1Q9Y3R0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIP1Q9Y3R0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIP1Q9Y3R0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIP1Q9Y3R0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIP1Q9Y3R0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIP1Q9Y3R0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GRIP1Q9Y3R0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIP1Q9Y3R0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIP1Q9Y3R0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIP1Q9Y3R0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIP1Q9Y3R0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIP1Q9Y3R0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIP1Q9Y3R0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIP1Q9Y3R0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIP1Q9Y3R0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIP1Q9Y3R0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIP1Q9Y3R0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIP1Q9Y3R0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIP1Q9Y3R0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GRIP1Q9Y3R0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GRIP1Q9Y3R0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIP1Q9Y3R0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIP1Q9Y3R0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIP1Q9Y3R0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIP1Q9Y3R0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIP1Q9Y3R0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIP1Q9Y3R0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIP1Q9Y3R0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIP1Q9Y3R0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIP1Q9Y3R0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIP1Q9Y3R0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIP1Q9Y3R0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms