Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNIP3Q9Y2W7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNIP3Q9Y2W7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNIP3Q9Y2W7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNIP3Q9Y2W7 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNIP3Q9Y2W7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNIP3Q9Y2W7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNIP3Q9Y2W7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNIP3Q9Y2W7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNIP3Q9Y2W7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
KCNIP3Q9Y2W7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNIP3Q9Y2W7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNIP3Q9Y2W7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNIP3Q9Y2W7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KCNIP3Q9Y2W7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNIP3Q9Y2W7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNIP3Q9Y2W7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNIP3Q9Y2W7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNIP3Q9Y2W7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
KCNIP3Q9Y2W7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNIP3Q9Y2W7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNIP3Q9Y2W7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNIP3Q9Y2W7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNIP3Q9Y2W7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNIP3Q9Y2W7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNIP3Q9Y2W7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNIP3Q9Y2W7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNIP3Q9Y2W7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNIP3Q9Y2W7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNIP3Q9Y2W7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNIP3Q9Y2W7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNIP3Q9Y2W7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNIP3Q9Y2W7 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNIP3Q9Y2W7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNIP3Q9Y2W7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNIP3Q9Y2W7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNIP3Q9Y2W7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNIP3Q9Y2W7 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNIP3Q9Y2W7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNIP3Q9Y2W7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNIP3Q9Y2W7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNIP3Q9Y2W7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KCNIP3Q9Y2W7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNIP3Q9Y2W7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNIP3Q9Y2W7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNIP3Q9Y2W7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNIP3Q9Y2W7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNIP3Q9Y2W7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNIP3Q9Y2W7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNIP3Q9Y2W7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNIP3Q9Y2W7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNIP3Q9Y2W7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNIP3Q9Y2W7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNIP3Q9Y2W7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNIP3Q9Y2W7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNIP3Q9Y2W7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNIP3Q9Y2W7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNIP3Q9Y2W7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNIP3Q9Y2W7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
KCNIP3Q9Y2W7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNIP3Q9Y2W7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNIP3Q9Y2W7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNIP3Q9Y2W7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNIP3Q9Y2W7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNIP3Q9Y2W7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNIP3Q9Y2W7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNIP3Q9Y2W7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNIP3Q9Y2W7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNIP3Q9Y2W7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNIP3Q9Y2W7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNIP3Q9Y2W7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNIP3Q9Y2W7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNIP3Q9Y2W7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNIP3Q9Y2W7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNIP3Q9Y2W7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNIP3Q9Y2W7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNIP3Q9Y2W7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNIP3Q9Y2W7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNIP3Q9Y2W7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNIP3Q9Y2W7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNIP3Q9Y2W7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNIP3Q9Y2W7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNIP3Q9Y2W7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNIP3Q9Y2W7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNIP3Q9Y2W7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNIP3Q9Y2W7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNIP3Q9Y2W7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNIP3Q9Y2W7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNIP3Q9Y2W7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNIP3Q9Y2W7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNIP3Q9Y2W7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNIP3Q9Y2W7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNIP3Q9Y2W7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNIP3Q9Y2W7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNIP3Q9Y2W7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNIP3Q9Y2W7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNIP3Q9Y2W7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNIP3Q9Y2W7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNIP3Q9Y2W7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNIP3Q9Y2W7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms