Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M5

KLHL20, Kelch-like protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 609 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL20Q9Y2M5 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KLHL20Q9Y2M5 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KLHL20Q9Y2M5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KLHL20Q9Y2M5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KLHL20Q9Y2M5 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KLHL20Q9Y2M5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KLHL20Q9Y2M5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
KLHL20Q9Y2M5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KLHL20Q9Y2M5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KLHL20Q9Y2M5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KLHL20Q9Y2M5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KLHL20Q9Y2M5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KLHL20Q9Y2M5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KLHL20Q9Y2M5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
KLHL20Q9Y2M5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KLHL20Q9Y2M5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KLHL20Q9Y2M5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KLHL20Q9Y2M5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
KLHL20Q9Y2M5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KLHL20Q9Y2M5 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KLHL20Q9Y2M5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KLHL20Q9Y2M5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KLHL20Q9Y2M5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KLHL20Q9Y2M5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KLHL20Q9Y2M5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KLHL20Q9Y2M5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KLHL20Q9Y2M5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
KLHL20Q9Y2M5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
KLHL20Q9Y2M5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KLHL20Q9Y2M5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KLHL20Q9Y2M5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KLHL20Q9Y2M5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KLHL20Q9Y2M5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
KLHL20Q9Y2M5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KLHL20Q9Y2M5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
KLHL20Q9Y2M5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.54■■■□□ 2
KLHL20Q9Y2M5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
KLHL20Q9Y2M5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KLHL20Q9Y2M5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KLHL20Q9Y2M5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KLHL20Q9Y2M5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KLHL20Q9Y2M5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KLHL20Q9Y2M5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KLHL20Q9Y2M5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KLHL20Q9Y2M5 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KLHL20Q9Y2M5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KLHL20Q9Y2M5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KLHL20Q9Y2M5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KLHL20Q9Y2M5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KLHL20Q9Y2M5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KLHL20Q9Y2M5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KLHL20Q9Y2M5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KLHL20Q9Y2M5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KLHL20Q9Y2M5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KLHL20Q9Y2M5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KLHL20Q9Y2M5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KLHL20Q9Y2M5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KLHL20Q9Y2M5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
KLHL20Q9Y2M5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KLHL20Q9Y2M5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KLHL20Q9Y2M5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KLHL20Q9Y2M5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KLHL20Q9Y2M5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KLHL20Q9Y2M5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KLHL20Q9Y2M5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KLHL20Q9Y2M5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KLHL20Q9Y2M5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KLHL20Q9Y2M5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KLHL20Q9Y2M5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KLHL20Q9Y2M5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KLHL20Q9Y2M5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KLHL20Q9Y2M5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KLHL20Q9Y2M5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KLHL20Q9Y2M5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KLHL20Q9Y2M5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KLHL20Q9Y2M5 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KLHL20Q9Y2M5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KLHL20Q9Y2M5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KLHL20Q9Y2M5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KLHL20Q9Y2M5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KLHL20Q9Y2M5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KLHL20Q9Y2M5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KLHL20Q9Y2M5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KLHL20Q9Y2M5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KLHL20Q9Y2M5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KLHL20Q9Y2M5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
KLHL20Q9Y2M5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KLHL20Q9Y2M5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KLHL20Q9Y2M5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KLHL20Q9Y2M5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KLHL20Q9Y2M5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KLHL20Q9Y2M5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KLHL20Q9Y2M5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KLHL20Q9Y2M5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KLHL20Q9Y2M5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KLHL20Q9Y2M5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KLHL20Q9Y2M5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KLHL20Q9Y2M5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KLHL20Q9Y2M5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KLHL20Q9Y2M5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms