Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR7

CLEC4A, C-type lectin domain family 4 member A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4AQ9UMR7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLEC4AQ9UMR7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLEC4AQ9UMR7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLEC4AQ9UMR7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CLEC4AQ9UMR7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLEC4AQ9UMR7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLEC4AQ9UMR7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLEC4AQ9UMR7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLEC4AQ9UMR7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLEC4AQ9UMR7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLEC4AQ9UMR7 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLEC4AQ9UMR7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLEC4AQ9UMR7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLEC4AQ9UMR7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLEC4AQ9UMR7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLEC4AQ9UMR7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLEC4AQ9UMR7 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLEC4AQ9UMR7 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLEC4AQ9UMR7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLEC4AQ9UMR7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLEC4AQ9UMR7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLEC4AQ9UMR7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CLEC4AQ9UMR7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLEC4AQ9UMR7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLEC4AQ9UMR7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLEC4AQ9UMR7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLEC4AQ9UMR7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLEC4AQ9UMR7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLEC4AQ9UMR7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLEC4AQ9UMR7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CLEC4AQ9UMR7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLEC4AQ9UMR7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLEC4AQ9UMR7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLEC4AQ9UMR7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLEC4AQ9UMR7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLEC4AQ9UMR7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLEC4AQ9UMR7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CLEC4AQ9UMR7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLEC4AQ9UMR7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLEC4AQ9UMR7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLEC4AQ9UMR7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLEC4AQ9UMR7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLEC4AQ9UMR7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLEC4AQ9UMR7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLEC4AQ9UMR7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLEC4AQ9UMR7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLEC4AQ9UMR7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLEC4AQ9UMR7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLEC4AQ9UMR7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLEC4AQ9UMR7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLEC4AQ9UMR7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLEC4AQ9UMR7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLEC4AQ9UMR7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLEC4AQ9UMR7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CLEC4AQ9UMR7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLEC4AQ9UMR7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLEC4AQ9UMR7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLEC4AQ9UMR7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLEC4AQ9UMR7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLEC4AQ9UMR7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLEC4AQ9UMR7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLEC4AQ9UMR7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLEC4AQ9UMR7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLEC4AQ9UMR7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLEC4AQ9UMR7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLEC4AQ9UMR7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLEC4AQ9UMR7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLEC4AQ9UMR7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLEC4AQ9UMR7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLEC4AQ9UMR7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLEC4AQ9UMR7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLEC4AQ9UMR7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLEC4AQ9UMR7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLEC4AQ9UMR7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLEC4AQ9UMR7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLEC4AQ9UMR7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLEC4AQ9UMR7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLEC4AQ9UMR7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLEC4AQ9UMR7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLEC4AQ9UMR7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLEC4AQ9UMR7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLEC4AQ9UMR7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLEC4AQ9UMR7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLEC4AQ9UMR7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLEC4AQ9UMR7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLEC4AQ9UMR7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLEC4AQ9UMR7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLEC4AQ9UMR7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLEC4AQ9UMR7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLEC4AQ9UMR7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLEC4AQ9UMR7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLEC4AQ9UMR7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLEC4AQ9UMR7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLEC4AQ9UMR7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLEC4AQ9UMR7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLEC4AQ9UMR7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLEC4AQ9UMR7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLEC4AQ9UMR7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLEC4AQ9UMR7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLEC4AQ9UMR7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.5 ms