Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM21

MGAT4A, Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase A, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGAT4AQ9UM21 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MGAT4AQ9UM21 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MGAT4AQ9UM21 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MGAT4AQ9UM21 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MGAT4AQ9UM21 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MGAT4AQ9UM21 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MGAT4AQ9UM21 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MGAT4AQ9UM21 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MGAT4AQ9UM21 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MGAT4AQ9UM21 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MGAT4AQ9UM21 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MGAT4AQ9UM21 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MGAT4AQ9UM21 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MGAT4AQ9UM21 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MGAT4AQ9UM21 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
MGAT4AQ9UM21 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MGAT4AQ9UM21 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MGAT4AQ9UM21 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MGAT4AQ9UM21 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MGAT4AQ9UM21 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MGAT4AQ9UM21 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MGAT4AQ9UM21 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MGAT4AQ9UM21 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MGAT4AQ9UM21 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MGAT4AQ9UM21 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MGAT4AQ9UM21 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MGAT4AQ9UM21 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MGAT4AQ9UM21 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MGAT4AQ9UM21 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MGAT4AQ9UM21 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MGAT4AQ9UM21 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MGAT4AQ9UM21 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MGAT4AQ9UM21 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MGAT4AQ9UM21 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MGAT4AQ9UM21 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MGAT4AQ9UM21 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MGAT4AQ9UM21 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MGAT4AQ9UM21 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MGAT4AQ9UM21 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MGAT4AQ9UM21 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MGAT4AQ9UM21 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MGAT4AQ9UM21 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MGAT4AQ9UM21 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MGAT4AQ9UM21 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MGAT4AQ9UM21 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MGAT4AQ9UM21 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MGAT4AQ9UM21 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MGAT4AQ9UM21 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MGAT4AQ9UM21 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MGAT4AQ9UM21 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MGAT4AQ9UM21 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MGAT4AQ9UM21 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MGAT4AQ9UM21 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MGAT4AQ9UM21 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MGAT4AQ9UM21 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MGAT4AQ9UM21 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MGAT4AQ9UM21 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MGAT4AQ9UM21 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MGAT4AQ9UM21 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MGAT4AQ9UM21 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MGAT4AQ9UM21 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MGAT4AQ9UM21 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MGAT4AQ9UM21 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MGAT4AQ9UM21 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MGAT4AQ9UM21 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MGAT4AQ9UM21 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MGAT4AQ9UM21 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MGAT4AQ9UM21 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MGAT4AQ9UM21 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MGAT4AQ9UM21 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MGAT4AQ9UM21 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MGAT4AQ9UM21 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MGAT4AQ9UM21 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MGAT4AQ9UM21 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MGAT4AQ9UM21 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MGAT4AQ9UM21 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MGAT4AQ9UM21 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MGAT4AQ9UM21 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MGAT4AQ9UM21 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MGAT4AQ9UM21 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MGAT4AQ9UM21 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MGAT4AQ9UM21 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MGAT4AQ9UM21 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MGAT4AQ9UM21 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MGAT4AQ9UM21 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MGAT4AQ9UM21 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MGAT4AQ9UM21 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MGAT4AQ9UM21 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MGAT4AQ9UM21 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MGAT4AQ9UM21 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MGAT4AQ9UM21 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MGAT4AQ9UM21 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MGAT4AQ9UM21 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MGAT4AQ9UM21 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MGAT4AQ9UM21 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MGAT4AQ9UM21 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MGAT4AQ9UM21 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MGAT4AQ9UM21 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MGAT4AQ9UM21 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MGAT4AQ9UM21 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms