Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC42EP3Q9UKI2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC42EP3Q9UKI2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC42EP3Q9UKI2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC42EP3Q9UKI2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC42EP3Q9UKI2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDC42EP3Q9UKI2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDC42EP3Q9UKI2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDC42EP3Q9UKI2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDC42EP3Q9UKI2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDC42EP3Q9UKI2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDC42EP3Q9UKI2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDC42EP3Q9UKI2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC42EP3Q9UKI2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC42EP3Q9UKI2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC42EP3Q9UKI2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CDC42EP3Q9UKI2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC42EP3Q9UKI2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDC42EP3Q9UKI2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC42EP3Q9UKI2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC42EP3Q9UKI2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDC42EP3Q9UKI2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDC42EP3Q9UKI2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC42EP3Q9UKI2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDC42EP3Q9UKI2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC42EP3Q9UKI2 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDC42EP3Q9UKI2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDC42EP3Q9UKI2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDC42EP3Q9UKI2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDC42EP3Q9UKI2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDC42EP3Q9UKI2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CDC42EP3Q9UKI2 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDC42EP3Q9UKI2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDC42EP3Q9UKI2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDC42EP3Q9UKI2 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDC42EP3Q9UKI2 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDC42EP3Q9UKI2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDC42EP3Q9UKI2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDC42EP3Q9UKI2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC42EP3Q9UKI2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC42EP3Q9UKI2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDC42EP3Q9UKI2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CDC42EP3Q9UKI2 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDC42EP3Q9UKI2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDC42EP3Q9UKI2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CDC42EP3Q9UKI2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDC42EP3Q9UKI2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDC42EP3Q9UKI2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC42EP3Q9UKI2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC42EP3Q9UKI2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC42EP3Q9UKI2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC42EP3Q9UKI2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC42EP3Q9UKI2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC42EP3Q9UKI2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC42EP3Q9UKI2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC42EP3Q9UKI2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDC42EP3Q9UKI2 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC42EP3Q9UKI2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC42EP3Q9UKI2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC42EP3Q9UKI2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDC42EP3Q9UKI2 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDC42EP3Q9UKI2 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDC42EP3Q9UKI2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDC42EP3Q9UKI2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDC42EP3Q9UKI2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDC42EP3Q9UKI2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDC42EP3Q9UKI2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDC42EP3Q9UKI2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC42EP3Q9UKI2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC42EP3Q9UKI2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDC42EP3Q9UKI2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDC42EP3Q9UKI2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC42EP3Q9UKI2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC42EP3Q9UKI2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC42EP3Q9UKI2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC42EP3Q9UKI2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC42EP3Q9UKI2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC42EP3Q9UKI2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC42EP3Q9UKI2 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDC42EP3Q9UKI2 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDC42EP3Q9UKI2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDC42EP3Q9UKI2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC42EP3Q9UKI2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CDC42EP3Q9UKI2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC42EP3Q9UKI2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDC42EP3Q9UKI2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC42EP3Q9UKI2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC42EP3Q9UKI2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC42EP3Q9UKI2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC42EP3Q9UKI2 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC42EP3Q9UKI2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC42EP3Q9UKI2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC42EP3Q9UKI2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC42EP3Q9UKI2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDC42EP3Q9UKI2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDC42EP3Q9UKI2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC42EP3Q9UKI2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC42EP3Q9UKI2 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC42EP3Q9UKI2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms