Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ83

HACL1, 2-hydroxyacyl-CoA lyase 1, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACL1Q9UJ83 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
HACL1Q9UJ83 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
HACL1Q9UJ83 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
HACL1Q9UJ83 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
HACL1Q9UJ83 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
HACL1Q9UJ83 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
HACL1Q9UJ83 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
HACL1Q9UJ83 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
HACL1Q9UJ83 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
HACL1Q9UJ83 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
HACL1Q9UJ83 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
HACL1Q9UJ83 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
HACL1Q9UJ83 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
HACL1Q9UJ83 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
HACL1Q9UJ83 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
HACL1Q9UJ83 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
HACL1Q9UJ83 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
HACL1Q9UJ83 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
HACL1Q9UJ83 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC35.59■■■■□ 3.29
HACL1Q9UJ83 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
HACL1Q9UJ83 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
HACL1Q9UJ83 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
HACL1Q9UJ83 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
HACL1Q9UJ83 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
HACL1Q9UJ83 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
HACL1Q9UJ83 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
HACL1Q9UJ83 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
HACL1Q9UJ83 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
HACL1Q9UJ83 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
HACL1Q9UJ83 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
HACL1Q9UJ83 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
HACL1Q9UJ83 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
HACL1Q9UJ83 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
HACL1Q9UJ83 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
HACL1Q9UJ83 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
HACL1Q9UJ83 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
HACL1Q9UJ83 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
HACL1Q9UJ83 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
HACL1Q9UJ83 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC35.31■■■■□ 3.24
HACL1Q9UJ83 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
HACL1Q9UJ83 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
HACL1Q9UJ83 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
HACL1Q9UJ83 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
HACL1Q9UJ83 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
HACL1Q9UJ83 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
HACL1Q9UJ83 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
HACL1Q9UJ83 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
HACL1Q9UJ83 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
HACL1Q9UJ83 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
HACL1Q9UJ83 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
HACL1Q9UJ83 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
HACL1Q9UJ83 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
HACL1Q9UJ83 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
HACL1Q9UJ83 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
HACL1Q9UJ83 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
HACL1Q9UJ83 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
HACL1Q9UJ83 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC35.04■■■■□ 3.2
HACL1Q9UJ83 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
HACL1Q9UJ83 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
HACL1Q9UJ83 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
HACL1Q9UJ83 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
HACL1Q9UJ83 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
HACL1Q9UJ83 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
HACL1Q9UJ83 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
HACL1Q9UJ83 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
HACL1Q9UJ83 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
HACL1Q9UJ83 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
HACL1Q9UJ83 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
HACL1Q9UJ83 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
HACL1Q9UJ83 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
HACL1Q9UJ83 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
HACL1Q9UJ83 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
HACL1Q9UJ83 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
HACL1Q9UJ83 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
HACL1Q9UJ83 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
HACL1Q9UJ83 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
HACL1Q9UJ83 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
HACL1Q9UJ83 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
HACL1Q9UJ83 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
HACL1Q9UJ83 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
HACL1Q9UJ83 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
HACL1Q9UJ83 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
HACL1Q9UJ83 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC34.63■■■■□ 3.13
HACL1Q9UJ83 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
HACL1Q9UJ83 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
HACL1Q9UJ83 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
HACL1Q9UJ83 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
HACL1Q9UJ83 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
HACL1Q9UJ83 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
HACL1Q9UJ83 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
HACL1Q9UJ83 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
HACL1Q9UJ83 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
HACL1Q9UJ83 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
HACL1Q9UJ83 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
HACL1Q9UJ83 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
HACL1Q9UJ83 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
HACL1Q9UJ83 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
HACL1Q9UJ83 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
HACL1Q9UJ83 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
HACL1Q9UJ83 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms