Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DUX4Q9UBX2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DUX4Q9UBX2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DUX4Q9UBX2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DUX4Q9UBX2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DUX4Q9UBX2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DUX4Q9UBX2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DUX4Q9UBX2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DUX4Q9UBX2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DUX4Q9UBX2 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DUX4Q9UBX2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DUX4Q9UBX2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DUX4Q9UBX2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DUX4Q9UBX2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DUX4Q9UBX2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DUX4Q9UBX2 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DUX4Q9UBX2 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
DUX4Q9UBX2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DUX4Q9UBX2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DUX4Q9UBX2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DUX4Q9UBX2 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DUX4Q9UBX2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DUX4Q9UBX2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DUX4Q9UBX2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DUX4Q9UBX2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DUX4Q9UBX2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DUX4Q9UBX2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
DUX4Q9UBX2 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DUX4Q9UBX2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DUX4Q9UBX2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DUX4Q9UBX2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
DUX4Q9UBX2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DUX4Q9UBX2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DUX4Q9UBX2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DUX4Q9UBX2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DUX4Q9UBX2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DUX4Q9UBX2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DUX4Q9UBX2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DUX4Q9UBX2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DUX4Q9UBX2 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DUX4Q9UBX2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DUX4Q9UBX2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DUX4Q9UBX2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DUX4Q9UBX2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DUX4Q9UBX2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DUX4Q9UBX2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DUX4Q9UBX2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DUX4Q9UBX2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DUX4Q9UBX2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DUX4Q9UBX2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DUX4Q9UBX2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DUX4Q9UBX2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DUX4Q9UBX2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DUX4Q9UBX2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DUX4Q9UBX2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DUX4Q9UBX2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DUX4Q9UBX2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DUX4Q9UBX2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DUX4Q9UBX2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DUX4Q9UBX2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DUX4Q9UBX2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
DUX4Q9UBX2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DUX4Q9UBX2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DUX4Q9UBX2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
DUX4Q9UBX2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DUX4Q9UBX2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DUX4Q9UBX2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DUX4Q9UBX2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DUX4Q9UBX2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DUX4Q9UBX2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DUX4Q9UBX2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DUX4Q9UBX2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DUX4Q9UBX2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DUX4Q9UBX2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DUX4Q9UBX2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DUX4Q9UBX2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DUX4Q9UBX2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DUX4Q9UBX2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DUX4Q9UBX2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DUX4Q9UBX2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DUX4Q9UBX2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DUX4Q9UBX2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DUX4Q9UBX2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DUX4Q9UBX2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DUX4Q9UBX2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DUX4Q9UBX2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DUX4Q9UBX2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DUX4Q9UBX2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DUX4Q9UBX2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DUX4Q9UBX2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DUX4Q9UBX2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DUX4Q9UBX2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DUX4Q9UBX2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DUX4Q9UBX2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DUX4Q9UBX2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DUX4Q9UBX2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
DUX4Q9UBX2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DUX4Q9UBX2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DUX4Q9UBX2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DUX4Q9UBX2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms