Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CTNNAL1Q9UBT7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CTNNAL1Q9UBT7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CTNNAL1Q9UBT7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CTNNAL1Q9UBT7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CTNNAL1Q9UBT7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CTNNAL1Q9UBT7 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CTNNAL1Q9UBT7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CTNNAL1Q9UBT7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CTNNAL1Q9UBT7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CTNNAL1Q9UBT7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CTNNAL1Q9UBT7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CTNNAL1Q9UBT7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CTNNAL1Q9UBT7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CTNNAL1Q9UBT7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CTNNAL1Q9UBT7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CTNNAL1Q9UBT7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CTNNAL1Q9UBT7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CTNNAL1Q9UBT7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CTNNAL1Q9UBT7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CTNNAL1Q9UBT7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CTNNAL1Q9UBT7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CTNNAL1Q9UBT7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CTNNAL1Q9UBT7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CTNNAL1Q9UBT7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CTNNAL1Q9UBT7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CTNNAL1Q9UBT7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CTNNAL1Q9UBT7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CTNNAL1Q9UBT7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CTNNAL1Q9UBT7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CTNNAL1Q9UBT7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CTNNAL1Q9UBT7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CTNNAL1Q9UBT7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CTNNAL1Q9UBT7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CTNNAL1Q9UBT7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CTNNAL1Q9UBT7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CTNNAL1Q9UBT7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CTNNAL1Q9UBT7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CTNNAL1Q9UBT7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CTNNAL1Q9UBT7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CTNNAL1Q9UBT7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CTNNAL1Q9UBT7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CTNNAL1Q9UBT7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CTNNAL1Q9UBT7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CTNNAL1Q9UBT7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CTNNAL1Q9UBT7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CTNNAL1Q9UBT7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CTNNAL1Q9UBT7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CTNNAL1Q9UBT7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CTNNAL1Q9UBT7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CTNNAL1Q9UBT7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CTNNAL1Q9UBT7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CTNNAL1Q9UBT7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CTNNAL1Q9UBT7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CTNNAL1Q9UBT7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CTNNAL1Q9UBT7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CTNNAL1Q9UBT7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CTNNAL1Q9UBT7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CTNNAL1Q9UBT7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CTNNAL1Q9UBT7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CTNNAL1Q9UBT7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CTNNAL1Q9UBT7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CTNNAL1Q9UBT7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CTNNAL1Q9UBT7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CTNNAL1Q9UBT7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CTNNAL1Q9UBT7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CTNNAL1Q9UBT7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CTNNAL1Q9UBT7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CTNNAL1Q9UBT7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CTNNAL1Q9UBT7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CTNNAL1Q9UBT7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CTNNAL1Q9UBT7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CTNNAL1Q9UBT7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CTNNAL1Q9UBT7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CTNNAL1Q9UBT7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CTNNAL1Q9UBT7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CTNNAL1Q9UBT7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CTNNAL1Q9UBT7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CTNNAL1Q9UBT7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CTNNAL1Q9UBT7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CTNNAL1Q9UBT7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CTNNAL1Q9UBT7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CTNNAL1Q9UBT7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CTNNAL1Q9UBT7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CTNNAL1Q9UBT7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CTNNAL1Q9UBT7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CTNNAL1Q9UBT7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CTNNAL1Q9UBT7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CTNNAL1Q9UBT7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CTNNAL1Q9UBT7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CTNNAL1Q9UBT7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CTNNAL1Q9UBT7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CTNNAL1Q9UBT7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CTNNAL1Q9UBT7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CTNNAL1Q9UBT7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CTNNAL1Q9UBT7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CTNNAL1Q9UBT7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CTNNAL1Q9UBT7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CTNNAL1Q9UBT7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms