Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Psma4Q9R1P0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Psma4Q9R1P0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Psma4Q9R1P0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Psma4Q9R1P0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Psma4Q9R1P0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Psma4Q9R1P0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Psma4Q9R1P0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Psma4Q9R1P0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Psma4Q9R1P0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Psma4Q9R1P0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Psma4Q9R1P0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Psma4Q9R1P0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Psma4Q9R1P0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Psma4Q9R1P0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Psma4Q9R1P0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Psma4Q9R1P0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Psma4Q9R1P0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Psma4Q9R1P0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Psma4Q9R1P0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Psma4Q9R1P0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Psma4Q9R1P0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Psma4Q9R1P0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Psma4Q9R1P0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Psma4Q9R1P0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Psma4Q9R1P0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Psma4Q9R1P0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Psma4Q9R1P0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Psma4Q9R1P0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Psma4Q9R1P0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Psma4Q9R1P0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Psma4Q9R1P0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Psma4Q9R1P0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Psma4Q9R1P0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Psma4Q9R1P0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Psma4Q9R1P0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Psma4Q9R1P0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Psma4Q9R1P0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Psma4Q9R1P0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Psma4Q9R1P0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Psma4Q9R1P0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Psma4Q9R1P0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Psma4Q9R1P0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Psma4Q9R1P0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Psma4Q9R1P0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Psma4Q9R1P0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Psma4Q9R1P0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Psma4Q9R1P0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Psma4Q9R1P0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Psma4Q9R1P0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Psma4Q9R1P0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Psma4Q9R1P0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Psma4Q9R1P0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Psma4Q9R1P0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Psma4Q9R1P0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Psma4Q9R1P0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Psma4Q9R1P0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Psma4Q9R1P0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Psma4Q9R1P0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Psma4Q9R1P0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Psma4Q9R1P0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Psma4Q9R1P0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Psma4Q9R1P0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Psma4Q9R1P0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Psma4Q9R1P0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Psma4Q9R1P0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Psma4Q9R1P0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Psma4Q9R1P0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Psma4Q9R1P0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Psma4Q9R1P0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Psma4Q9R1P0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Psma4Q9R1P0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Psma4Q9R1P0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Psma4Q9R1P0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Psma4Q9R1P0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Psma4Q9R1P0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Psma4Q9R1P0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Psma4Q9R1P0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Psma4Q9R1P0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Psma4Q9R1P0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Psma4Q9R1P0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Psma4Q9R1P0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Psma4Q9R1P0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Psma4Q9R1P0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Psma4Q9R1P0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Psma4Q9R1P0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Psma4Q9R1P0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Psma4Q9R1P0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Psma4Q9R1P0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Psma4Q9R1P0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Psma4Q9R1P0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Psma4Q9R1P0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Psma4Q9R1P0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Psma4Q9R1P0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Psma4Q9R1P0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Psma4Q9R1P0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Psma4Q9R1P0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Psma4Q9R1P0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Psma4Q9R1P0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Psma4Q9R1P0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms