Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q9

Mpdu1, Mannose-P-dolichol utilization defect 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mpdu1Q9R0Q9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mpdu1Q9R0Q9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mpdu1Q9R0Q9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mpdu1Q9R0Q9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Mpdu1Q9R0Q9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mpdu1Q9R0Q9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mpdu1Q9R0Q9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mpdu1Q9R0Q9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mpdu1Q9R0Q9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mpdu1Q9R0Q9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mpdu1Q9R0Q9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mpdu1Q9R0Q9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mpdu1Q9R0Q9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mpdu1Q9R0Q9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mpdu1Q9R0Q9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mpdu1Q9R0Q9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mpdu1Q9R0Q9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mpdu1Q9R0Q9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mpdu1Q9R0Q9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mpdu1Q9R0Q9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mpdu1Q9R0Q9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mpdu1Q9R0Q9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mpdu1Q9R0Q9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mpdu1Q9R0Q9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mpdu1Q9R0Q9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Mpdu1Q9R0Q9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mpdu1Q9R0Q9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mpdu1Q9R0Q9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mpdu1Q9R0Q9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mpdu1Q9R0Q9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Mpdu1Q9R0Q9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mpdu1Q9R0Q9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mpdu1Q9R0Q9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mpdu1Q9R0Q9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mpdu1Q9R0Q9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mpdu1Q9R0Q9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mpdu1Q9R0Q9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mpdu1Q9R0Q9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mpdu1Q9R0Q9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mpdu1Q9R0Q9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mpdu1Q9R0Q9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mpdu1Q9R0Q9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mpdu1Q9R0Q9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Mpdu1Q9R0Q9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mpdu1Q9R0Q9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mpdu1Q9R0Q9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mpdu1Q9R0Q9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mpdu1Q9R0Q9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mpdu1Q9R0Q9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mpdu1Q9R0Q9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Mpdu1Q9R0Q9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mpdu1Q9R0Q9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Mpdu1Q9R0Q9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Mpdu1Q9R0Q9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mpdu1Q9R0Q9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mpdu1Q9R0Q9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Mpdu1Q9R0Q9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mpdu1Q9R0Q9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mpdu1Q9R0Q9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mpdu1Q9R0Q9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mpdu1Q9R0Q9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mpdu1Q9R0Q9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mpdu1Q9R0Q9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mpdu1Q9R0Q9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mpdu1Q9R0Q9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mpdu1Q9R0Q9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Mpdu1Q9R0Q9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mpdu1Q9R0Q9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mpdu1Q9R0Q9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
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Mpdu1Q9R0Q9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mpdu1Q9R0Q9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mpdu1Q9R0Q9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mpdu1Q9R0Q9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Mpdu1Q9R0Q9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mpdu1Q9R0Q9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mpdu1Q9R0Q9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mpdu1Q9R0Q9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mpdu1Q9R0Q9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Mpdu1Q9R0Q9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mpdu1Q9R0Q9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mpdu1Q9R0Q9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mpdu1Q9R0Q9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mpdu1Q9R0Q9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Mpdu1Q9R0Q9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mpdu1Q9R0Q9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mpdu1Q9R0Q9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mpdu1Q9R0Q9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mpdu1Q9R0Q9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mpdu1Q9R0Q9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mpdu1Q9R0Q9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mpdu1Q9R0Q9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mpdu1Q9R0Q9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mpdu1Q9R0Q9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mpdu1Q9R0Q9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Mpdu1Q9R0Q9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mpdu1Q9R0Q9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mpdu1Q9R0Q9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mpdu1Q9R0Q9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mpdu1Q9R0Q9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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