Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD5

Chml, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmlQ9QZD5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ChmlQ9QZD5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ChmlQ9QZD5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ChmlQ9QZD5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ChmlQ9QZD5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ChmlQ9QZD5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ChmlQ9QZD5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ChmlQ9QZD5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ChmlQ9QZD5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ChmlQ9QZD5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ChmlQ9QZD5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ChmlQ9QZD5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ChmlQ9QZD5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
ChmlQ9QZD5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ChmlQ9QZD5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ChmlQ9QZD5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ChmlQ9QZD5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ChmlQ9QZD5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ChmlQ9QZD5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ChmlQ9QZD5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ChmlQ9QZD5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ChmlQ9QZD5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ChmlQ9QZD5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ChmlQ9QZD5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ChmlQ9QZD5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ChmlQ9QZD5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ChmlQ9QZD5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ChmlQ9QZD5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ChmlQ9QZD5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ChmlQ9QZD5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ChmlQ9QZD5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ChmlQ9QZD5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ChmlQ9QZD5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ChmlQ9QZD5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ChmlQ9QZD5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ChmlQ9QZD5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ChmlQ9QZD5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ChmlQ9QZD5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ChmlQ9QZD5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ChmlQ9QZD5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ChmlQ9QZD5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ChmlQ9QZD5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ChmlQ9QZD5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ChmlQ9QZD5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ChmlQ9QZD5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ChmlQ9QZD5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ChmlQ9QZD5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ChmlQ9QZD5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ChmlQ9QZD5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ChmlQ9QZD5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ChmlQ9QZD5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ChmlQ9QZD5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ChmlQ9QZD5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ChmlQ9QZD5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ChmlQ9QZD5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ChmlQ9QZD5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ChmlQ9QZD5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ChmlQ9QZD5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ChmlQ9QZD5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ChmlQ9QZD5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ChmlQ9QZD5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ChmlQ9QZD5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ChmlQ9QZD5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ChmlQ9QZD5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ChmlQ9QZD5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ChmlQ9QZD5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ChmlQ9QZD5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ChmlQ9QZD5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ChmlQ9QZD5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ChmlQ9QZD5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ChmlQ9QZD5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ChmlQ9QZD5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ChmlQ9QZD5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ChmlQ9QZD5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ChmlQ9QZD5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ChmlQ9QZD5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ChmlQ9QZD5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ChmlQ9QZD5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ChmlQ9QZD5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ChmlQ9QZD5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ChmlQ9QZD5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ChmlQ9QZD5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ChmlQ9QZD5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ChmlQ9QZD5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ChmlQ9QZD5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ChmlQ9QZD5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ChmlQ9QZD5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ChmlQ9QZD5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ChmlQ9QZD5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ChmlQ9QZD5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ChmlQ9QZD5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ChmlQ9QZD5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ChmlQ9QZD5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ChmlQ9QZD5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ChmlQ9QZD5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ChmlQ9QZD5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ChmlQ9QZD5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ChmlQ9QZD5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ChmlQ9QZD5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ChmlQ9QZD5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms