Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYE3

Bcl11a, B-cell lymphoma/leukemia 11A, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11aQ9QYE3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Bcl11aQ9QYE3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Bcl11aQ9QYE3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Bcl11aQ9QYE3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Bcl11aQ9QYE3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Bcl11aQ9QYE3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Bcl11aQ9QYE3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Bcl11aQ9QYE3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Bcl11aQ9QYE3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
Bcl11aQ9QYE3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Bcl11aQ9QYE3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Bcl11aQ9QYE3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Bcl11aQ9QYE3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Bcl11aQ9QYE3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Bcl11aQ9QYE3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Bcl11aQ9QYE3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Bcl11aQ9QYE3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Bcl11aQ9QYE3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Bcl11aQ9QYE3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Bcl11aQ9QYE3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Bcl11aQ9QYE3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
Bcl11aQ9QYE3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Bcl11aQ9QYE3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Bcl11aQ9QYE3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Bcl11aQ9QYE3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Bcl11aQ9QYE3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Bcl11aQ9QYE3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Bcl11aQ9QYE3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Bcl11aQ9QYE3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Bcl11aQ9QYE3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Bcl11aQ9QYE3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Bcl11aQ9QYE3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Bcl11aQ9QYE3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Bcl11aQ9QYE3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Bcl11aQ9QYE3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Bcl11aQ9QYE3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Bcl11aQ9QYE3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Bcl11aQ9QYE3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Bcl11aQ9QYE3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Bcl11aQ9QYE3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
Bcl11aQ9QYE3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Bcl11aQ9QYE3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Bcl11aQ9QYE3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
Bcl11aQ9QYE3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Bcl11aQ9QYE3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Bcl11aQ9QYE3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Bcl11aQ9QYE3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Bcl11aQ9QYE3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Bcl11aQ9QYE3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Bcl11aQ9QYE3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Bcl11aQ9QYE3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Bcl11aQ9QYE3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Bcl11aQ9QYE3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Bcl11aQ9QYE3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Bcl11aQ9QYE3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Bcl11aQ9QYE3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Bcl11aQ9QYE3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Bcl11aQ9QYE3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Bcl11aQ9QYE3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Bcl11aQ9QYE3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Bcl11aQ9QYE3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Bcl11aQ9QYE3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Bcl11aQ9QYE3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Bcl11aQ9QYE3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Bcl11aQ9QYE3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Bcl11aQ9QYE3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Bcl11aQ9QYE3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Bcl11aQ9QYE3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Bcl11aQ9QYE3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Bcl11aQ9QYE3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Bcl11aQ9QYE3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Bcl11aQ9QYE3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Bcl11aQ9QYE3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Bcl11aQ9QYE3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Bcl11aQ9QYE3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Bcl11aQ9QYE3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Bcl11aQ9QYE3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Bcl11aQ9QYE3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Bcl11aQ9QYE3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
Bcl11aQ9QYE3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Bcl11aQ9QYE3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Bcl11aQ9QYE3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Bcl11aQ9QYE3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Bcl11aQ9QYE3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Bcl11aQ9QYE3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Bcl11aQ9QYE3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Bcl11aQ9QYE3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
Bcl11aQ9QYE3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Bcl11aQ9QYE3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Bcl11aQ9QYE3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Bcl11aQ9QYE3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
Bcl11aQ9QYE3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Bcl11aQ9QYE3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Bcl11aQ9QYE3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Bcl11aQ9QYE3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Bcl11aQ9QYE3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Bcl11aQ9QYE3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Bcl11aQ9QYE3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Bcl11aQ9QYE3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Bcl11aQ9QYE3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.8 ms