Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM9

Psma6, Proteasome subunit alpha type-6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma6Q9QUM9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Psma6Q9QUM9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Psma6Q9QUM9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Psma6Q9QUM9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Psma6Q9QUM9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Psma6Q9QUM9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Psma6Q9QUM9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Psma6Q9QUM9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Psma6Q9QUM9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Psma6Q9QUM9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Psma6Q9QUM9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Psma6Q9QUM9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Psma6Q9QUM9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Psma6Q9QUM9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psma6Q9QUM9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psma6Q9QUM9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Psma6Q9QUM9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Psma6Q9QUM9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Psma6Q9QUM9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Psma6Q9QUM9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Psma6Q9QUM9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Psma6Q9QUM9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Psma6Q9QUM9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Psma6Q9QUM9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Psma6Q9QUM9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Psma6Q9QUM9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Psma6Q9QUM9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Psma6Q9QUM9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Psma6Q9QUM9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Psma6Q9QUM9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Psma6Q9QUM9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Psma6Q9QUM9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Psma6Q9QUM9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Psma6Q9QUM9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Psma6Q9QUM9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Psma6Q9QUM9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Psma6Q9QUM9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Psma6Q9QUM9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Psma6Q9QUM9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Psma6Q9QUM9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Psma6Q9QUM9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Psma6Q9QUM9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Psma6Q9QUM9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Psma6Q9QUM9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Psma6Q9QUM9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Psma6Q9QUM9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Psma6Q9QUM9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Psma6Q9QUM9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Psma6Q9QUM9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Psma6Q9QUM9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Psma6Q9QUM9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Psma6Q9QUM9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Psma6Q9QUM9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Psma6Q9QUM9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psma6Q9QUM9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psma6Q9QUM9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psma6Q9QUM9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Psma6Q9QUM9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psma6Q9QUM9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psma6Q9QUM9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psma6Q9QUM9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psma6Q9QUM9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psma6Q9QUM9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psma6Q9QUM9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psma6Q9QUM9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psma6Q9QUM9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psma6Q9QUM9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psma6Q9QUM9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Psma6Q9QUM9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psma6Q9QUM9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Psma6Q9QUM9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psma6Q9QUM9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psma6Q9QUM9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Psma6Q9QUM9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Psma6Q9QUM9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psma6Q9QUM9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psma6Q9QUM9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psma6Q9QUM9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psma6Q9QUM9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Psma6Q9QUM9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psma6Q9QUM9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psma6Q9QUM9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Psma6Q9QUM9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psma6Q9QUM9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Psma6Q9QUM9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Psma6Q9QUM9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Psma6Q9QUM9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psma6Q9QUM9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psma6Q9QUM9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psma6Q9QUM9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Psma6Q9QUM9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Psma6Q9QUM9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Psma6Q9QUM9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Psma6Q9QUM9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Psma6Q9QUM9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Psma6Q9QUM9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psma6Q9QUM9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Psma6Q9QUM9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Psma6Q9QUM9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psma6Q9QUM9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms