Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KLHL28Q9NXS3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KLHL28Q9NXS3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KLHL28Q9NXS3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
KLHL28Q9NXS3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KLHL28Q9NXS3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KLHL28Q9NXS3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KLHL28Q9NXS3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KLHL28Q9NXS3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KLHL28Q9NXS3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KLHL28Q9NXS3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KLHL28Q9NXS3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KLHL28Q9NXS3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KLHL28Q9NXS3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KLHL28Q9NXS3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KLHL28Q9NXS3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KLHL28Q9NXS3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KLHL28Q9NXS3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KLHL28Q9NXS3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KLHL28Q9NXS3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
KLHL28Q9NXS3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KLHL28Q9NXS3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KLHL28Q9NXS3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KLHL28Q9NXS3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KLHL28Q9NXS3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KLHL28Q9NXS3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KLHL28Q9NXS3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KLHL28Q9NXS3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KLHL28Q9NXS3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KLHL28Q9NXS3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KLHL28Q9NXS3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KLHL28Q9NXS3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLHL28Q9NXS3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLHL28Q9NXS3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLHL28Q9NXS3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KLHL28Q9NXS3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KLHL28Q9NXS3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLHL28Q9NXS3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLHL28Q9NXS3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLHL28Q9NXS3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLHL28Q9NXS3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHL28Q9NXS3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KLHL28Q9NXS3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KLHL28Q9NXS3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KLHL28Q9NXS3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KLHL28Q9NXS3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KLHL28Q9NXS3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KLHL28Q9NXS3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KLHL28Q9NXS3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KLHL28Q9NXS3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KLHL28Q9NXS3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KLHL28Q9NXS3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KLHL28Q9NXS3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
KLHL28Q9NXS3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KLHL28Q9NXS3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KLHL28Q9NXS3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KLHL28Q9NXS3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KLHL28Q9NXS3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KLHL28Q9NXS3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KLHL28Q9NXS3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KLHL28Q9NXS3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KLHL28Q9NXS3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KLHL28Q9NXS3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KLHL28Q9NXS3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KLHL28Q9NXS3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KLHL28Q9NXS3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KLHL28Q9NXS3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KLHL28Q9NXS3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KLHL28Q9NXS3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KLHL28Q9NXS3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KLHL28Q9NXS3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KLHL28Q9NXS3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KLHL28Q9NXS3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KLHL28Q9NXS3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KLHL28Q9NXS3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KLHL28Q9NXS3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KLHL28Q9NXS3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KLHL28Q9NXS3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KLHL28Q9NXS3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KLHL28Q9NXS3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KLHL28Q9NXS3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KLHL28Q9NXS3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHL28Q9NXS3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHL28Q9NXS3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHL28Q9NXS3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHL28Q9NXS3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KLHL28Q9NXS3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KLHL28Q9NXS3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KLHL28Q9NXS3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLHL28Q9NXS3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KLHL28Q9NXS3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KLHL28Q9NXS3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KLHL28Q9NXS3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KLHL28Q9NXS3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KLHL28Q9NXS3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KLHL28Q9NXS3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KLHL28Q9NXS3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KLHL28Q9NXS3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
KLHL28Q9NXS3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KLHL28Q9NXS3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms