Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXB0

MKS1, Meckel syndrome type 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1Q9NXB0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MKS1Q9NXB0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MKS1Q9NXB0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MKS1Q9NXB0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MKS1Q9NXB0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MKS1Q9NXB0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MKS1Q9NXB0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MKS1Q9NXB0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MKS1Q9NXB0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MKS1Q9NXB0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MKS1Q9NXB0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MKS1Q9NXB0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MKS1Q9NXB0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MKS1Q9NXB0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MKS1Q9NXB0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MKS1Q9NXB0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MKS1Q9NXB0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MKS1Q9NXB0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MKS1Q9NXB0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MKS1Q9NXB0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MKS1Q9NXB0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MKS1Q9NXB0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MKS1Q9NXB0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MKS1Q9NXB0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MKS1Q9NXB0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MKS1Q9NXB0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MKS1Q9NXB0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MKS1Q9NXB0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MKS1Q9NXB0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MKS1Q9NXB0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MKS1Q9NXB0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MKS1Q9NXB0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MKS1Q9NXB0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MKS1Q9NXB0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MKS1Q9NXB0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MKS1Q9NXB0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MKS1Q9NXB0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MKS1Q9NXB0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MKS1Q9NXB0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MKS1Q9NXB0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MKS1Q9NXB0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MKS1Q9NXB0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MKS1Q9NXB0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MKS1Q9NXB0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MKS1Q9NXB0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MKS1Q9NXB0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MKS1Q9NXB0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MKS1Q9NXB0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MKS1Q9NXB0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
MKS1Q9NXB0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MKS1Q9NXB0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MKS1Q9NXB0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MKS1Q9NXB0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MKS1Q9NXB0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MKS1Q9NXB0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
MKS1Q9NXB0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MKS1Q9NXB0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MKS1Q9NXB0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MKS1Q9NXB0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MKS1Q9NXB0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MKS1Q9NXB0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MKS1Q9NXB0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MKS1Q9NXB0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MKS1Q9NXB0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
MKS1Q9NXB0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MKS1Q9NXB0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MKS1Q9NXB0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MKS1Q9NXB0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MKS1Q9NXB0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MKS1Q9NXB0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MKS1Q9NXB0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MKS1Q9NXB0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MKS1Q9NXB0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MKS1Q9NXB0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MKS1Q9NXB0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MKS1Q9NXB0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MKS1Q9NXB0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MKS1Q9NXB0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MKS1Q9NXB0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MKS1Q9NXB0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MKS1Q9NXB0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MKS1Q9NXB0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MKS1Q9NXB0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MKS1Q9NXB0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MKS1Q9NXB0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MKS1Q9NXB0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MKS1Q9NXB0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MKS1Q9NXB0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MKS1Q9NXB0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MKS1Q9NXB0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MKS1Q9NXB0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MKS1Q9NXB0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MKS1Q9NXB0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MKS1Q9NXB0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MKS1Q9NXB0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MKS1Q9NXB0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MKS1Q9NXB0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MKS1Q9NXB0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MKS1Q9NXB0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MKS1Q9NXB0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms