Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS68

TNFRSF19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF19Q9NS68 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFRSF19Q9NS68 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNFRSF19Q9NS68 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TNFRSF19Q9NS68 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFRSF19Q9NS68 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFRSF19Q9NS68 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNFRSF19Q9NS68 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNFRSF19Q9NS68 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFRSF19Q9NS68 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFRSF19Q9NS68 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFRSF19Q9NS68 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TNFRSF19Q9NS68 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF19Q9NS68 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFRSF19Q9NS68 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFRSF19Q9NS68 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFRSF19Q9NS68 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TNFRSF19Q9NS68 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFRSF19Q9NS68 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFRSF19Q9NS68 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFRSF19Q9NS68 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TNFRSF19Q9NS68 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TNFRSF19Q9NS68 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFRSF19Q9NS68 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFRSF19Q9NS68 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFRSF19Q9NS68 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFRSF19Q9NS68 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFRSF19Q9NS68 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFRSF19Q9NS68 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFRSF19Q9NS68 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFRSF19Q9NS68 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFRSF19Q9NS68 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFRSF19Q9NS68 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNFRSF19Q9NS68 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFRSF19Q9NS68 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFRSF19Q9NS68 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFRSF19Q9NS68 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFRSF19Q9NS68 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFRSF19Q9NS68 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFRSF19Q9NS68 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFRSF19Q9NS68 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFRSF19Q9NS68 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFRSF19Q9NS68 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFRSF19Q9NS68 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFRSF19Q9NS68 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFRSF19Q9NS68 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFRSF19Q9NS68 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFRSF19Q9NS68 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFRSF19Q9NS68 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFRSF19Q9NS68 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFRSF19Q9NS68 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFRSF19Q9NS68 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFRSF19Q9NS68 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFRSF19Q9NS68 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFRSF19Q9NS68 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFRSF19Q9NS68 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNFRSF19Q9NS68 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNFRSF19Q9NS68 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF19Q9NS68 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF19Q9NS68 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF19Q9NS68 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF19Q9NS68 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF19Q9NS68 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF19Q9NS68 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF19Q9NS68 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF19Q9NS68 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF19Q9NS68 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF19Q9NS68 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF19Q9NS68 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF19Q9NS68 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF19Q9NS68 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFRSF19Q9NS68 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFRSF19Q9NS68 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFRSF19Q9NS68 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFRSF19Q9NS68 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFRSF19Q9NS68 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFRSF19Q9NS68 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFRSF19Q9NS68 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFRSF19Q9NS68 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFRSF19Q9NS68 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFRSF19Q9NS68 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFRSF19Q9NS68 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFRSF19Q9NS68 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFRSF19Q9NS68 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFRSF19Q9NS68 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFRSF19Q9NS68 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFRSF19Q9NS68 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF19Q9NS68 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF19Q9NS68 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF19Q9NS68 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF19Q9NS68 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF19Q9NS68 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF19Q9NS68 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF19Q9NS68 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFRSF19Q9NS68 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFRSF19Q9NS68 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFRSF19Q9NS68 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFRSF19Q9NS68 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFRSF19Q9NS68 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFRSF19Q9NS68 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFRSF19Q9NS68 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms