Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK97

Kcnq4, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 4, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnq4Q9JK97 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Kcnq4Q9JK97 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Kcnq4Q9JK97 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Kcnq4Q9JK97 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Kcnq4Q9JK97 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Kcnq4Q9JK97 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Kcnq4Q9JK97 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Kcnq4Q9JK97 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Kcnq4Q9JK97 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Kcnq4Q9JK97 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Kcnq4Q9JK97 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Kcnq4Q9JK97 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Kcnq4Q9JK97 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Kcnq4Q9JK97 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Kcnq4Q9JK97 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Kcnq4Q9JK97 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Kcnq4Q9JK97 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Kcnq4Q9JK97 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Kcnq4Q9JK97 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Kcnq4Q9JK97 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Kcnq4Q9JK97 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Kcnq4Q9JK97 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Kcnq4Q9JK97 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Kcnq4Q9JK97 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Kcnq4Q9JK97 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Kcnq4Q9JK97 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Kcnq4Q9JK97 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Kcnq4Q9JK97 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Kcnq4Q9JK97 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Kcnq4Q9JK97 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Kcnq4Q9JK97 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Kcnq4Q9JK97 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Kcnq4Q9JK97 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Kcnq4Q9JK97 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Kcnq4Q9JK97 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Kcnq4Q9JK97 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Kcnq4Q9JK97 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Kcnq4Q9JK97 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Kcnq4Q9JK97 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Kcnq4Q9JK97 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Kcnq4Q9JK97 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Kcnq4Q9JK97 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Kcnq4Q9JK97 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Kcnq4Q9JK97 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Kcnq4Q9JK97 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Kcnq4Q9JK97 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Kcnq4Q9JK97 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Kcnq4Q9JK97 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Kcnq4Q9JK97 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Kcnq4Q9JK97 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Kcnq4Q9JK97 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Kcnq4Q9JK97 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Kcnq4Q9JK97 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Kcnq4Q9JK97 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Kcnq4Q9JK97 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Kcnq4Q9JK97 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Kcnq4Q9JK97 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Kcnq4Q9JK97 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Kcnq4Q9JK97 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Kcnq4Q9JK97 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Kcnq4Q9JK97 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Kcnq4Q9JK97 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Kcnq4Q9JK97 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Kcnq4Q9JK97 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Kcnq4Q9JK97 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Kcnq4Q9JK97 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Kcnq4Q9JK97 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Kcnq4Q9JK97 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Kcnq4Q9JK97 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Kcnq4Q9JK97 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Kcnq4Q9JK97 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Kcnq4Q9JK97 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Kcnq4Q9JK97 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Kcnq4Q9JK97 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Kcnq4Q9JK97 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Kcnq4Q9JK97 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Kcnq4Q9JK97 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Kcnq4Q9JK97 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Kcnq4Q9JK97 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Kcnq4Q9JK97 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Kcnq4Q9JK97 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Kcnq4Q9JK97 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Kcnq4Q9JK97 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Kcnq4Q9JK97 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Kcnq4Q9JK97 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Kcnq4Q9JK97 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Kcnq4Q9JK97 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Kcnq4Q9JK97 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Kcnq4Q9JK97 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Kcnq4Q9JK97 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Kcnq4Q9JK97 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Kcnq4Q9JK97 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Kcnq4Q9JK97 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Kcnq4Q9JK97 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Kcnq4Q9JK97 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Kcnq4Q9JK97 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Kcnq4Q9JK97 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Kcnq4Q9JK97 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Kcnq4Q9JK97 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Kcnq4Q9JK97 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms