Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CYP4F12Q9HCS2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CYP4F12Q9HCS2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CYP4F12Q9HCS2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CYP4F12Q9HCS2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CYP4F12Q9HCS2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CYP4F12Q9HCS2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CYP4F12Q9HCS2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CYP4F12Q9HCS2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CYP4F12Q9HCS2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CYP4F12Q9HCS2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CYP4F12Q9HCS2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CYP4F12Q9HCS2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CYP4F12Q9HCS2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CYP4F12Q9HCS2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CYP4F12Q9HCS2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CYP4F12Q9HCS2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CYP4F12Q9HCS2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CYP4F12Q9HCS2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CYP4F12Q9HCS2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CYP4F12Q9HCS2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CYP4F12Q9HCS2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CYP4F12Q9HCS2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CYP4F12Q9HCS2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CYP4F12Q9HCS2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CYP4F12Q9HCS2 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CYP4F12Q9HCS2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CYP4F12Q9HCS2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CYP4F12Q9HCS2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CYP4F12Q9HCS2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CYP4F12Q9HCS2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CYP4F12Q9HCS2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CYP4F12Q9HCS2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CYP4F12Q9HCS2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CYP4F12Q9HCS2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CYP4F12Q9HCS2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CYP4F12Q9HCS2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CYP4F12Q9HCS2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CYP4F12Q9HCS2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CYP4F12Q9HCS2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CYP4F12Q9HCS2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CYP4F12Q9HCS2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CYP4F12Q9HCS2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CYP4F12Q9HCS2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CYP4F12Q9HCS2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CYP4F12Q9HCS2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CYP4F12Q9HCS2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CYP4F12Q9HCS2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CYP4F12Q9HCS2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CYP4F12Q9HCS2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CYP4F12Q9HCS2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CYP4F12Q9HCS2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CYP4F12Q9HCS2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CYP4F12Q9HCS2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CYP4F12Q9HCS2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CYP4F12Q9HCS2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CYP4F12Q9HCS2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CYP4F12Q9HCS2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CYP4F12Q9HCS2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CYP4F12Q9HCS2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CYP4F12Q9HCS2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CYP4F12Q9HCS2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CYP4F12Q9HCS2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CYP4F12Q9HCS2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CYP4F12Q9HCS2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CYP4F12Q9HCS2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CYP4F12Q9HCS2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CYP4F12Q9HCS2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CYP4F12Q9HCS2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CYP4F12Q9HCS2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CYP4F12Q9HCS2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CYP4F12Q9HCS2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CYP4F12Q9HCS2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CYP4F12Q9HCS2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CYP4F12Q9HCS2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CYP4F12Q9HCS2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CYP4F12Q9HCS2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CYP4F12Q9HCS2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CYP4F12Q9HCS2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CYP4F12Q9HCS2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CYP4F12Q9HCS2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CYP4F12Q9HCS2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
CYP4F12Q9HCS2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CYP4F12Q9HCS2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CYP4F12Q9HCS2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CYP4F12Q9HCS2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CYP4F12Q9HCS2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CYP4F12Q9HCS2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CYP4F12Q9HCS2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CYP4F12Q9HCS2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CYP4F12Q9HCS2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CYP4F12Q9HCS2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CYP4F12Q9HCS2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CYP4F12Q9HCS2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CYP4F12Q9HCS2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CYP4F12Q9HCS2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CYP4F12Q9HCS2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CYP4F12Q9HCS2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CYP4F12Q9HCS2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CYP4F12Q9HCS2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms