Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9K5

ERVMER34-1, Endogenous retrovirus group MER34 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVMER34-1Q9H9K5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ERVMER34-1Q9H9K5 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ERVMER34-1Q9H9K5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ERVMER34-1Q9H9K5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ERVMER34-1Q9H9K5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ERVMER34-1Q9H9K5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ERVMER34-1Q9H9K5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ERVMER34-1Q9H9K5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ERVMER34-1Q9H9K5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ERVMER34-1Q9H9K5 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ERVMER34-1Q9H9K5 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ERVMER34-1Q9H9K5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ERVMER34-1Q9H9K5 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ERVMER34-1Q9H9K5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ERVMER34-1Q9H9K5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ERVMER34-1Q9H9K5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ERVMER34-1Q9H9K5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ERVMER34-1Q9H9K5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ERVMER34-1Q9H9K5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ERVMER34-1Q9H9K5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ERVMER34-1Q9H9K5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ERVMER34-1Q9H9K5 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ERVMER34-1Q9H9K5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ERVMER34-1Q9H9K5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ERVMER34-1Q9H9K5 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ERVMER34-1Q9H9K5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ERVMER34-1Q9H9K5 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ERVMER34-1Q9H9K5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ERVMER34-1Q9H9K5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ERVMER34-1Q9H9K5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ERVMER34-1Q9H9K5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ERVMER34-1Q9H9K5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ERVMER34-1Q9H9K5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ERVMER34-1Q9H9K5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ERVMER34-1Q9H9K5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ERVMER34-1Q9H9K5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ERVMER34-1Q9H9K5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ERVMER34-1Q9H9K5 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ERVMER34-1Q9H9K5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ERVMER34-1Q9H9K5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ERVMER34-1Q9H9K5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ERVMER34-1Q9H9K5 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ERVMER34-1Q9H9K5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ERVMER34-1Q9H9K5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ERVMER34-1Q9H9K5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ERVMER34-1Q9H9K5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ERVMER34-1Q9H9K5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
ERVMER34-1Q9H9K5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ERVMER34-1Q9H9K5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ERVMER34-1Q9H9K5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ERVMER34-1Q9H9K5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ERVMER34-1Q9H9K5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ERVMER34-1Q9H9K5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ERVMER34-1Q9H9K5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ERVMER34-1Q9H9K5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ERVMER34-1Q9H9K5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ERVMER34-1Q9H9K5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ERVMER34-1Q9H9K5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ERVMER34-1Q9H9K5 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ERVMER34-1Q9H9K5 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ERVMER34-1Q9H9K5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ERVMER34-1Q9H9K5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ERVMER34-1Q9H9K5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ERVMER34-1Q9H9K5 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ERVMER34-1Q9H9K5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ERVMER34-1Q9H9K5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ERVMER34-1Q9H9K5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ERVMER34-1Q9H9K5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ERVMER34-1Q9H9K5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ERVMER34-1Q9H9K5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ERVMER34-1Q9H9K5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ERVMER34-1Q9H9K5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ERVMER34-1Q9H9K5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ERVMER34-1Q9H9K5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ERVMER34-1Q9H9K5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ERVMER34-1Q9H9K5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ERVMER34-1Q9H9K5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ERVMER34-1Q9H9K5 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ERVMER34-1Q9H9K5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ERVMER34-1Q9H9K5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ERVMER34-1Q9H9K5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ERVMER34-1Q9H9K5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ERVMER34-1Q9H9K5 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ERVMER34-1Q9H9K5 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ERVMER34-1Q9H9K5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ERVMER34-1Q9H9K5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ERVMER34-1Q9H9K5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ERVMER34-1Q9H9K5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ERVMER34-1Q9H9K5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ERVMER34-1Q9H9K5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ERVMER34-1Q9H9K5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ERVMER34-1Q9H9K5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ERVMER34-1Q9H9K5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ERVMER34-1Q9H9K5 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ERVMER34-1Q9H9K5 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ERVMER34-1Q9H9K5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ERVMER34-1Q9H9K5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
ERVMER34-1Q9H9K5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ERVMER34-1Q9H9K5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ERVMER34-1Q9H9K5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms