Protein–RNA interactions for Protein: Q9H159

CDH19, Cadherin-19, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH19Q9H159 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDH19Q9H159 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CDH19Q9H159 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CDH19Q9H159 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDH19Q9H159 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CDH19Q9H159 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CDH19Q9H159 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDH19Q9H159 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CDH19Q9H159 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CDH19Q9H159 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDH19Q9H159 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDH19Q9H159 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDH19Q9H159 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDH19Q9H159 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDH19Q9H159 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDH19Q9H159 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDH19Q9H159 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDH19Q9H159 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDH19Q9H159 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDH19Q9H159 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CDH19Q9H159 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CDH19Q9H159 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDH19Q9H159 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDH19Q9H159 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDH19Q9H159 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDH19Q9H159 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDH19Q9H159 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDH19Q9H159 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDH19Q9H159 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CDH19Q9H159 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CDH19Q9H159 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDH19Q9H159 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDH19Q9H159 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDH19Q9H159 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDH19Q9H159 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDH19Q9H159 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDH19Q9H159 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDH19Q9H159 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDH19Q9H159 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDH19Q9H159 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDH19Q9H159 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDH19Q9H159 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDH19Q9H159 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDH19Q9H159 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDH19Q9H159 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDH19Q9H159 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDH19Q9H159 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDH19Q9H159 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDH19Q9H159 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CDH19Q9H159 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDH19Q9H159 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDH19Q9H159 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CDH19Q9H159 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDH19Q9H159 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDH19Q9H159 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDH19Q9H159 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDH19Q9H159 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDH19Q9H159 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDH19Q9H159 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDH19Q9H159 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDH19Q9H159 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDH19Q9H159 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDH19Q9H159 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDH19Q9H159 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CDH19Q9H159 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDH19Q9H159 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDH19Q9H159 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDH19Q9H159 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDH19Q9H159 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDH19Q9H159 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDH19Q9H159 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDH19Q9H159 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDH19Q9H159 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDH19Q9H159 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDH19Q9H159 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CDH19Q9H159 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDH19Q9H159 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDH19Q9H159 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDH19Q9H159 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDH19Q9H159 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDH19Q9H159 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDH19Q9H159 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDH19Q9H159 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDH19Q9H159 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDH19Q9H159 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDH19Q9H159 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDH19Q9H159 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDH19Q9H159 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDH19Q9H159 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDH19Q9H159 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDH19Q9H159 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDH19Q9H159 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDH19Q9H159 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDH19Q9H159 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDH19Q9H159 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDH19Q9H159 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDH19Q9H159 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDH19Q9H159 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDH19Q9H159 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDH19Q9H159 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms