Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ16

Cxcr6, C-X-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr6Q9EQ16 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cxcr6Q9EQ16 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cxcr6Q9EQ16 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cxcr6Q9EQ16 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cxcr6Q9EQ16 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cxcr6Q9EQ16 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cxcr6Q9EQ16 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cxcr6Q9EQ16 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cxcr6Q9EQ16 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cxcr6Q9EQ16 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cxcr6Q9EQ16 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cxcr6Q9EQ16 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cxcr6Q9EQ16 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cxcr6Q9EQ16 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cxcr6Q9EQ16 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cxcr6Q9EQ16 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cxcr6Q9EQ16 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cxcr6Q9EQ16 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cxcr6Q9EQ16 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cxcr6Q9EQ16 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cxcr6Q9EQ16 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cxcr6Q9EQ16 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cxcr6Q9EQ16 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cxcr6Q9EQ16 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cxcr6Q9EQ16 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cxcr6Q9EQ16 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cxcr6Q9EQ16 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cxcr6Q9EQ16 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cxcr6Q9EQ16 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cxcr6Q9EQ16 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cxcr6Q9EQ16 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cxcr6Q9EQ16 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cxcr6Q9EQ16 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cxcr6Q9EQ16 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cxcr6Q9EQ16 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cxcr6Q9EQ16 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cxcr6Q9EQ16 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cxcr6Q9EQ16 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cxcr6Q9EQ16 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cxcr6Q9EQ16 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cxcr6Q9EQ16 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cxcr6Q9EQ16 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cxcr6Q9EQ16 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cxcr6Q9EQ16 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cxcr6Q9EQ16 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cxcr6Q9EQ16 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cxcr6Q9EQ16 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Cxcr6Q9EQ16 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Cxcr6Q9EQ16 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cxcr6Q9EQ16 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cxcr6Q9EQ16 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cxcr6Q9EQ16 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cxcr6Q9EQ16 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cxcr6Q9EQ16 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cxcr6Q9EQ16 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cxcr6Q9EQ16 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Cxcr6Q9EQ16 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cxcr6Q9EQ16 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cxcr6Q9EQ16 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cxcr6Q9EQ16 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cxcr6Q9EQ16 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cxcr6Q9EQ16 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cxcr6Q9EQ16 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cxcr6Q9EQ16 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cxcr6Q9EQ16 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cxcr6Q9EQ16 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cxcr6Q9EQ16 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cxcr6Q9EQ16 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cxcr6Q9EQ16 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cxcr6Q9EQ16 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cxcr6Q9EQ16 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cxcr6Q9EQ16 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cxcr6Q9EQ16 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cxcr6Q9EQ16 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cxcr6Q9EQ16 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cxcr6Q9EQ16 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Cxcr6Q9EQ16 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cxcr6Q9EQ16 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cxcr6Q9EQ16 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cxcr6Q9EQ16 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Cxcr6Q9EQ16 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cxcr6Q9EQ16 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cxcr6Q9EQ16 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cxcr6Q9EQ16 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cxcr6Q9EQ16 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cxcr6Q9EQ16 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cxcr6Q9EQ16 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cxcr6Q9EQ16 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cxcr6Q9EQ16 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Cxcr6Q9EQ16 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cxcr6Q9EQ16 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cxcr6Q9EQ16 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cxcr6Q9EQ16 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cxcr6Q9EQ16 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Cxcr6Q9EQ16 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cxcr6Q9EQ16 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cxcr6Q9EQ16 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Cxcr6Q9EQ16 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cxcr6Q9EQ16 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cxcr6Q9EQ16 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms