Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

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Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tlr1Q9EPQ1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tlr1Q9EPQ1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tlr1Q9EPQ1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tlr1Q9EPQ1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tlr1Q9EPQ1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tlr1Q9EPQ1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Tlr1Q9EPQ1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tlr1Q9EPQ1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tlr1Q9EPQ1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tlr1Q9EPQ1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tlr1Q9EPQ1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tlr1Q9EPQ1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tlr1Q9EPQ1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tlr1Q9EPQ1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tlr1Q9EPQ1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tlr1Q9EPQ1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tlr1Q9EPQ1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tlr1Q9EPQ1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tlr1Q9EPQ1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tlr1Q9EPQ1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tlr1Q9EPQ1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tlr1Q9EPQ1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tlr1Q9EPQ1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tlr1Q9EPQ1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Tlr1Q9EPQ1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tlr1Q9EPQ1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tlr1Q9EPQ1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tlr1Q9EPQ1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tlr1Q9EPQ1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tlr1Q9EPQ1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tlr1Q9EPQ1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tlr1Q9EPQ1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tlr1Q9EPQ1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tlr1Q9EPQ1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tlr1Q9EPQ1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tlr1Q9EPQ1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tlr1Q9EPQ1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tlr1Q9EPQ1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tlr1Q9EPQ1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tlr1Q9EPQ1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Tlr1Q9EPQ1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tlr1Q9EPQ1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tlr1Q9EPQ1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tlr1Q9EPQ1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tlr1Q9EPQ1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tlr1Q9EPQ1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tlr1Q9EPQ1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tlr1Q9EPQ1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tlr1Q9EPQ1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tlr1Q9EPQ1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tlr1Q9EPQ1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tlr1Q9EPQ1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tlr1Q9EPQ1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tlr1Q9EPQ1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tlr1Q9EPQ1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Tlr1Q9EPQ1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Tlr1Q9EPQ1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tlr1Q9EPQ1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tlr1Q9EPQ1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tlr1Q9EPQ1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Tlr1Q9EPQ1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tlr1Q9EPQ1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tlr1Q9EPQ1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tlr1Q9EPQ1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tlr1Q9EPQ1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tlr1Q9EPQ1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tlr1Q9EPQ1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tlr1Q9EPQ1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tlr1Q9EPQ1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tlr1Q9EPQ1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tlr1Q9EPQ1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tlr1Q9EPQ1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tlr1Q9EPQ1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tlr1Q9EPQ1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tlr1Q9EPQ1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tlr1Q9EPQ1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tlr1Q9EPQ1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tlr1Q9EPQ1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Tlr1Q9EPQ1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tlr1Q9EPQ1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tlr1Q9EPQ1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tlr1Q9EPQ1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tlr1Q9EPQ1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tlr1Q9EPQ1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tlr1Q9EPQ1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tlr1Q9EPQ1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tlr1Q9EPQ1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tlr1Q9EPQ1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tlr1Q9EPQ1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tlr1Q9EPQ1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tlr1Q9EPQ1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tlr1Q9EPQ1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tlr1Q9EPQ1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Tlr1Q9EPQ1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tlr1Q9EPQ1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tlr1Q9EPQ1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tlr1Q9EPQ1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tlr1Q9EPQ1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tlr1Q9EPQ1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms