Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3R6

Katnal2, Katanin p60 ATPase-containing subunit A-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnal2Q9D3R6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Katnal2Q9D3R6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Katnal2Q9D3R6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Katnal2Q9D3R6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Katnal2Q9D3R6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Katnal2Q9D3R6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Katnal2Q9D3R6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Katnal2Q9D3R6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Katnal2Q9D3R6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Katnal2Q9D3R6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Katnal2Q9D3R6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Katnal2Q9D3R6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Katnal2Q9D3R6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Katnal2Q9D3R6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Katnal2Q9D3R6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Katnal2Q9D3R6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Katnal2Q9D3R6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Katnal2Q9D3R6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Katnal2Q9D3R6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Katnal2Q9D3R6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Katnal2Q9D3R6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Katnal2Q9D3R6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Katnal2Q9D3R6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Katnal2Q9D3R6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Katnal2Q9D3R6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Katnal2Q9D3R6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Katnal2Q9D3R6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Katnal2Q9D3R6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Katnal2Q9D3R6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Katnal2Q9D3R6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Katnal2Q9D3R6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Katnal2Q9D3R6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Katnal2Q9D3R6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Katnal2Q9D3R6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Katnal2Q9D3R6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Katnal2Q9D3R6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Katnal2Q9D3R6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Katnal2Q9D3R6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Katnal2Q9D3R6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Katnal2Q9D3R6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Katnal2Q9D3R6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Katnal2Q9D3R6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Katnal2Q9D3R6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Katnal2Q9D3R6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Katnal2Q9D3R6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Katnal2Q9D3R6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Katnal2Q9D3R6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Katnal2Q9D3R6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Katnal2Q9D3R6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Katnal2Q9D3R6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Katnal2Q9D3R6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Katnal2Q9D3R6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Katnal2Q9D3R6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Katnal2Q9D3R6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Katnal2Q9D3R6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Katnal2Q9D3R6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Katnal2Q9D3R6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Katnal2Q9D3R6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Katnal2Q9D3R6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Katnal2Q9D3R6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Katnal2Q9D3R6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Katnal2Q9D3R6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Katnal2Q9D3R6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Katnal2Q9D3R6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Katnal2Q9D3R6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Katnal2Q9D3R6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Katnal2Q9D3R6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Katnal2Q9D3R6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Katnal2Q9D3R6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Katnal2Q9D3R6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Katnal2Q9D3R6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Katnal2Q9D3R6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Katnal2Q9D3R6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Katnal2Q9D3R6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Katnal2Q9D3R6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Katnal2Q9D3R6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Katnal2Q9D3R6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Katnal2Q9D3R6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Katnal2Q9D3R6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Katnal2Q9D3R6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Katnal2Q9D3R6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Katnal2Q9D3R6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Katnal2Q9D3R6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Katnal2Q9D3R6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Katnal2Q9D3R6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Katnal2Q9D3R6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Katnal2Q9D3R6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Katnal2Q9D3R6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Katnal2Q9D3R6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Katnal2Q9D3R6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Katnal2Q9D3R6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Katnal2Q9D3R6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Katnal2Q9D3R6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Katnal2Q9D3R6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Katnal2Q9D3R6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Katnal2Q9D3R6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Katnal2Q9D3R6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Katnal2Q9D3R6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Katnal2Q9D3R6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Katnal2Q9D3R6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.1 ms