Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWI3

Bccip, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BccipQ9CWI3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
BccipQ9CWI3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
BccipQ9CWI3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
BccipQ9CWI3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
BccipQ9CWI3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
BccipQ9CWI3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
BccipQ9CWI3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
BccipQ9CWI3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
BccipQ9CWI3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
BccipQ9CWI3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
BccipQ9CWI3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
BccipQ9CWI3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
BccipQ9CWI3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
BccipQ9CWI3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
BccipQ9CWI3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
BccipQ9CWI3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
BccipQ9CWI3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
BccipQ9CWI3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
BccipQ9CWI3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
BccipQ9CWI3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
BccipQ9CWI3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
BccipQ9CWI3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
BccipQ9CWI3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
BccipQ9CWI3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
BccipQ9CWI3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
BccipQ9CWI3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
BccipQ9CWI3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
BccipQ9CWI3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
BccipQ9CWI3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
BccipQ9CWI3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
BccipQ9CWI3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
BccipQ9CWI3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
BccipQ9CWI3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
BccipQ9CWI3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
BccipQ9CWI3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
BccipQ9CWI3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
BccipQ9CWI3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
BccipQ9CWI3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
BccipQ9CWI3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
BccipQ9CWI3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
BccipQ9CWI3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
BccipQ9CWI3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
BccipQ9CWI3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
BccipQ9CWI3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
BccipQ9CWI3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
BccipQ9CWI3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
BccipQ9CWI3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
BccipQ9CWI3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
BccipQ9CWI3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
BccipQ9CWI3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
BccipQ9CWI3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
BccipQ9CWI3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
BccipQ9CWI3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
BccipQ9CWI3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
BccipQ9CWI3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
BccipQ9CWI3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
BccipQ9CWI3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
BccipQ9CWI3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
BccipQ9CWI3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
BccipQ9CWI3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
BccipQ9CWI3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
BccipQ9CWI3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
BccipQ9CWI3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
BccipQ9CWI3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
BccipQ9CWI3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
BccipQ9CWI3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
BccipQ9CWI3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
BccipQ9CWI3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
BccipQ9CWI3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
BccipQ9CWI3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
BccipQ9CWI3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
BccipQ9CWI3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
BccipQ9CWI3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
BccipQ9CWI3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
BccipQ9CWI3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
BccipQ9CWI3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
BccipQ9CWI3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
BccipQ9CWI3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
BccipQ9CWI3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
BccipQ9CWI3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
BccipQ9CWI3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
BccipQ9CWI3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
BccipQ9CWI3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
BccipQ9CWI3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
BccipQ9CWI3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
BccipQ9CWI3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
BccipQ9CWI3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
BccipQ9CWI3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
BccipQ9CWI3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
BccipQ9CWI3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
BccipQ9CWI3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
BccipQ9CWI3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
BccipQ9CWI3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
BccipQ9CWI3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
BccipQ9CWI3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
BccipQ9CWI3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
BccipQ9CWI3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
BccipQ9CWI3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
BccipQ9CWI3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
BccipQ9CWI3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms