Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE2

Tmem223, Transmembrane protein 223, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem223Q9CQE2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem223Q9CQE2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmem223Q9CQE2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmem223Q9CQE2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmem223Q9CQE2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmem223Q9CQE2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmem223Q9CQE2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmem223Q9CQE2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmem223Q9CQE2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmem223Q9CQE2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmem223Q9CQE2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmem223Q9CQE2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmem223Q9CQE2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmem223Q9CQE2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmem223Q9CQE2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem223Q9CQE2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem223Q9CQE2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem223Q9CQE2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem223Q9CQE2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem223Q9CQE2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem223Q9CQE2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem223Q9CQE2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem223Q9CQE2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem223Q9CQE2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem223Q9CQE2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem223Q9CQE2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem223Q9CQE2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem223Q9CQE2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem223Q9CQE2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem223Q9CQE2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem223Q9CQE2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem223Q9CQE2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem223Q9CQE2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem223Q9CQE2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem223Q9CQE2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem223Q9CQE2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem223Q9CQE2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem223Q9CQE2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem223Q9CQE2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem223Q9CQE2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem223Q9CQE2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem223Q9CQE2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem223Q9CQE2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem223Q9CQE2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem223Q9CQE2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem223Q9CQE2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem223Q9CQE2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem223Q9CQE2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem223Q9CQE2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem223Q9CQE2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem223Q9CQE2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem223Q9CQE2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem223Q9CQE2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem223Q9CQE2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem223Q9CQE2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem223Q9CQE2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmem223Q9CQE2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmem223Q9CQE2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmem223Q9CQE2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem223Q9CQE2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem223Q9CQE2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem223Q9CQE2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem223Q9CQE2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem223Q9CQE2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem223Q9CQE2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem223Q9CQE2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem223Q9CQE2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem223Q9CQE2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem223Q9CQE2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem223Q9CQE2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem223Q9CQE2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem223Q9CQE2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem223Q9CQE2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem223Q9CQE2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem223Q9CQE2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem223Q9CQE2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem223Q9CQE2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem223Q9CQE2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem223Q9CQE2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem223Q9CQE2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem223Q9CQE2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem223Q9CQE2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem223Q9CQE2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem223Q9CQE2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem223Q9CQE2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem223Q9CQE2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem223Q9CQE2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tmem223Q9CQE2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tmem223Q9CQE2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem223Q9CQE2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem223Q9CQE2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem223Q9CQE2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem223Q9CQE2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem223Q9CQE2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem223Q9CQE2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem223Q9CQE2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem223Q9CQE2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem223Q9CQE2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmem223Q9CQE2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmem223Q9CQE2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms