Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD4

Chmp1b2, Charged multivesicular body protein 1b-2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b2Q9CQD4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chmp1b2Q9CQD4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chmp1b2Q9CQD4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Chmp1b2Q9CQD4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Chmp1b2Q9CQD4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Chmp1b2Q9CQD4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chmp1b2Q9CQD4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chmp1b2Q9CQD4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chmp1b2Q9CQD4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chmp1b2Q9CQD4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Chmp1b2Q9CQD4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chmp1b2Q9CQD4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chmp1b2Q9CQD4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chmp1b2Q9CQD4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chmp1b2Q9CQD4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chmp1b2Q9CQD4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chmp1b2Q9CQD4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chmp1b2Q9CQD4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chmp1b2Q9CQD4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chmp1b2Q9CQD4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chmp1b2Q9CQD4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chmp1b2Q9CQD4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Chmp1b2Q9CQD4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Chmp1b2Q9CQD4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chmp1b2Q9CQD4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chmp1b2Q9CQD4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chmp1b2Q9CQD4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chmp1b2Q9CQD4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chmp1b2Q9CQD4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chmp1b2Q9CQD4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chmp1b2Q9CQD4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chmp1b2Q9CQD4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chmp1b2Q9CQD4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chmp1b2Q9CQD4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chmp1b2Q9CQD4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chmp1b2Q9CQD4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Chmp1b2Q9CQD4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chmp1b2Q9CQD4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chmp1b2Q9CQD4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chmp1b2Q9CQD4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Chmp1b2Q9CQD4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chmp1b2Q9CQD4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chmp1b2Q9CQD4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chmp1b2Q9CQD4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Chmp1b2Q9CQD4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Chmp1b2Q9CQD4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chmp1b2Q9CQD4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chmp1b2Q9CQD4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chmp1b2Q9CQD4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chmp1b2Q9CQD4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chmp1b2Q9CQD4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chmp1b2Q9CQD4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chmp1b2Q9CQD4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chmp1b2Q9CQD4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chmp1b2Q9CQD4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chmp1b2Q9CQD4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chmp1b2Q9CQD4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Chmp1b2Q9CQD4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chmp1b2Q9CQD4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Chmp1b2Q9CQD4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Chmp1b2Q9CQD4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chmp1b2Q9CQD4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chmp1b2Q9CQD4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chmp1b2Q9CQD4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chmp1b2Q9CQD4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chmp1b2Q9CQD4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chmp1b2Q9CQD4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chmp1b2Q9CQD4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chmp1b2Q9CQD4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chmp1b2Q9CQD4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chmp1b2Q9CQD4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Chmp1b2Q9CQD4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chmp1b2Q9CQD4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chmp1b2Q9CQD4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chmp1b2Q9CQD4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Chmp1b2Q9CQD4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chmp1b2Q9CQD4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chmp1b2Q9CQD4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chmp1b2Q9CQD4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chmp1b2Q9CQD4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Chmp1b2Q9CQD4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chmp1b2Q9CQD4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chmp1b2Q9CQD4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chmp1b2Q9CQD4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chmp1b2Q9CQD4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chmp1b2Q9CQD4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chmp1b2Q9CQD4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Chmp1b2Q9CQD4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chmp1b2Q9CQD4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chmp1b2Q9CQD4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Chmp1b2Q9CQD4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chmp1b2Q9CQD4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chmp1b2Q9CQD4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chmp1b2Q9CQD4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chmp1b2Q9CQD4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chmp1b2Q9CQD4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chmp1b2Q9CQD4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chmp1b2Q9CQD4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chmp1b2Q9CQD4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chmp1b2Q9CQD4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms