Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B1

FTO, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase FTO, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FTOQ9C0B1 PTPRN2-202ENST00000389416 4692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.061e-6■■■■■ 50.8
FTOQ9C0B1 PTPRN2-203ENST00000389418 4706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.11e-6■■■■■ 50.8
FTOQ9C0B1 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.81e-10■■■■■ 49.6
FTOQ9C0B1 MICALL2-208ENST00000472100 5248 ntTSL 219.96■□□□□ 0.791e-10■■■■■ 49.6
FTOQ9C0B1 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.71e-10■■■■■ 49.6
FTOQ9C0B1 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.491e-10■■■■■ 49.6
FTOQ9C0B1 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.231e-10■■■■■ 49.6
FTOQ9C0B1 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.161e-10■■■■■ 49.6
FTOQ9C0B1 MICALL2-202ENST00000413446 3046 ntTSL 215.95■□□□□ 0.141e-10■■■■■ 49.6
FTOQ9C0B1 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.131e-10■■■■■ 49.6
FTOQ9C0B1 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.171e-10■■■■■ 49.6
FTOQ9C0B1 ABCC4-201ENST00000376887 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.971e-10■■■■■ 49.6
FTOQ9C0B1 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.059e-7■■■■■ 49.4
FTOQ9C0B1 SBNO2-207ENST00000590176 561 ntTSL 421.48■■□□□ 1.039e-7■■■■■ 49.4
FTOQ9C0B1 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.649e-7■■■■■ 49.4
FTOQ9C0B1 MAT1A-202ENST00000455001 435 ntTSL 512.15□□□□□ -0.465e-9■■■■■ 48.3
FTOQ9C0B1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.882e-7■■■■■ 47.9
FTOQ9C0B1 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.732e-7■■■■■ 47.9
FTOQ9C0B1 SERINC2-204ENST00000491976 2807 ntTSL 219.46■□□□□ 0.712e-7■■■■■ 47.9
FTOQ9C0B1 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.672e-7■■■■■ 47.9
FTOQ9C0B1 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.362e-7■■■■■ 47.9
FTOQ9C0B1 ESRRA-206ENST00000539594 747 ntTSL 331.69■■■□□ 2.664e-10■■■■■ 47.3
FTOQ9C0B1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.574e-10■■■■■ 47.3
FTOQ9C0B1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.024e-10■■■■■ 47.3
FTOQ9C0B1 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.751e-8■■■■■ 46.2
FTOQ9C0B1 FOXN3-204ENST00000553840 555 ntTSL 420.34■□□□□ 0.851e-11■■■■■ 45.9
FTOQ9C0B1 FOXN3-219ENST00000615335 2421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.031e-11■■■■■ 45.9
FTOQ9C0B1 FOXN3-201ENST00000261302 2542 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.111e-11■■■■■ 45.9
FTOQ9C0B1 FOXN3-218ENST00000557718 398 ntTSL 56.8□□□□□ -1.321e-11■■■■■ 45.9
FTOQ9C0B1 FOXN3-206ENST00000554005 450 ntTSL 55.27□□□□□ -1.571e-11■■■■■ 45.9
FTOQ9C0B1 FOXN3-203ENST00000553353 366 ntTSL 34.06□□□□□ -1.761e-11■■■■■ 45.9
FTOQ9C0B1 FOXN3-213ENST00000556916 467 ntTSL 34.05□□□□□ -1.761e-11■■■■■ 45.9
FTOQ9C0B1 PID1-206ENST00000534952 553 ntTSL 415.82■□□□□ 0.122e-6■■■■■ 45.8
FTOQ9C0B1 PID1-204ENST00000409462 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 02e-6■■■■■ 45.8
FTOQ9C0B1 PID1-203ENST00000392055 2533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.022e-6■■■■■ 45.8
FTOQ9C0B1 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.022e-6■■■■■ 45.8
FTOQ9C0B1 PID1-201ENST00000354069 839 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.932e-6■■■■■ 45.8
FTOQ9C0B1 PID1-205ENST00000482518 479 ntTSL 25.84□□□□□ -1.472e-6■■■■■ 45.8
FTOQ9C0B1 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.91e-6■■■■■ 45.7
FTOQ9C0B1 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.668e-10■■■■■ 45.6
FTOQ9C0B1 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.736e-7■■■■■ 45.2
FTOQ9C0B1 ANKRD11-210ENST00000566858 580 ntTSL 418.53■□□□□ 0.561e-9■■■■■ 44.9
FTOQ9C0B1 ANKRD11-213ENST00000567736 2750 ntTSL 217.68■□□□□ 0.421e-9■■■■■ 44.9
FTOQ9C0B1 ANKRD11-212ENST00000567699 412 ntTSL 517.47■□□□□ 0.391e-9■■■■■ 44.9
FTOQ9C0B1 ANKRD11-206ENST00000562275 2762 ntTSL 516.45■□□□□ 0.221e-9■■■■■ 44.9
FTOQ9C0B1 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.221e-9■■■■■ 44.9
FTOQ9C0B1 ANKRD11-216ENST00000568924 587 ntTSL 415.64■□□□□ 0.091e-9■■■■■ 44.9
FTOQ9C0B1 ANKRD11-209ENST00000564553 471 ntTSL 315.41■□□□□ 0.061e-9■■■■■ 44.9
FTOQ9C0B1 ANKRD11-202ENST00000330736 8342 ntTSL 514.71□□□□□ -0.051e-9■■■■■ 44.9
FTOQ9C0B1 ANKRD11-207ENST00000562816 573 ntTSL 413.4□□□□□ -0.261e-9■■■■■ 44.9
FTOQ9C0B1 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.569e-8■■■■■ 44.8
FTOQ9C0B1 MINK1-209ENST00000574453 4941 ntTSL 1 (best)18.06■□□□□ 0.489e-8■■■■■ 44.8
FTOQ9C0B1 MINK1-207ENST00000572330 5299 ntTSL 517.42■□□□□ 0.389e-8■■■■■ 44.8
FTOQ9C0B1 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.339e-8■■■■■ 44.8
FTOQ9C0B1 MINK1-203ENST00000453408 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.19e-8■■■■■ 44.8
FTOQ9C0B1 MINK1-213ENST00000577021 675 ntTSL 511.67□□□□□ -0.549e-8■■■■■ 44.8
FTOQ9C0B1 RNASET2-209ENST00000499370 2164 ntTSL 212.86□□□□□ -0.357e-16■■■■■ 43.7
FTOQ9C0B1 RNASET2-208ENST00000496851 881 ntTSL 511.33□□□□□ -0.67e-16■■■■■ 43.7
FTOQ9C0B1 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.247e-9■■■■■ 43.7
FTOQ9C0B1 FAM98B-204ENST00000559431 305 ntTSL 512.39□□□□□ -0.437e-9■■■■■ 43.7
FTOQ9C0B1 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.517e-16■■■■■ 43.3
FTOQ9C0B1 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.026e-8■■■■■ 43
FTOQ9C0B1 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.896e-8■■■■■ 43
FTOQ9C0B1 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.846e-8■■■■■ 43
FTOQ9C0B1 STXBP2-211ENST00000597068 1785 ntTSL 1 (best)16.95■□□□□ 0.36e-8■■■■■ 43
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FTOQ9C0B1 STXBP2-217ENST00000599737 1523 ntTSL 516.6■□□□□ 0.256e-8■■■■■ 43
FTOQ9C0B1 STXBP2-219ENST00000600702 770 ntTSL 215.23■□□□□ 0.036e-8■■■■■ 43
FTOQ9C0B1 BAZ2A-210ENST00000549787 2773 ntTSL 1 (best)14.79□□□□□ -0.047e-11■■■■■ 42.9
FTOQ9C0B1 BAZ2A-201ENST00000379441 8831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.457e-11■■■■■ 42.9
FTOQ9C0B1 BAZ2A-211ENST00000549884 6050 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.587e-11■■■■■ 42.9
FTOQ9C0B1 BAZ2A-214ENST00000551812 8600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.77e-11■■■■■ 42.9
FTOQ9C0B1 KDM2B-216ENST00000543025 2522 ntTSL 1 (best)19.43■□□□□ 0.72e-7■■■■■ 42.9
FTOQ9C0B1 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.362e-7■■■■■ 42.9
FTOQ9C0B1 KDM2B-214ENST00000542030 460 ntTSL 416.18■□□□□ 0.182e-7■■■■■ 42.9
FTOQ9C0B1 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.172e-7■■■■■ 42.9
FTOQ9C0B1 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.162e-7■■■■■ 42.9
FTOQ9C0B1 KDM2B-203ENST00000446152 1549 ntTSL 515.68■□□□□ 0.12e-7■■■■■ 42.9
FTOQ9C0B1 KDM2B-219ENST00000611216 3434 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.072e-7■■■■■ 42.9
FTOQ9C0B1 KDM2B-209ENST00000538503 6676 ntTSL 515.44■□□□□ 0.062e-7■■■■■ 42.9
FTOQ9C0B1 KDM2B-212ENST00000541318 600 ntTSL 411.3□□□□□ -0.62e-7■■■■■ 42.9
FTOQ9C0B1 KDM2B-206ENST00000538046 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.682e-7■■■■■ 42.9
FTOQ9C0B1 KDM2B-208ENST00000538379 574 ntTSL 49.53□□□□□ -0.882e-7■■■■■ 42.9
FTOQ9C0B1 KDM2B-218ENST00000545022 544 ntTSL 47.48□□□□□ -1.212e-7■■■■■ 42.9
FTOQ9C0B1 RBPJ-216ENST00000509158 555 ntTSL 223.34■■□□□ 1.333e-9■■■■■ 42.9
FTOQ9C0B1 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.693e-9■■■■■ 42.9
FTOQ9C0B1 RBPJ-223ENST00000512671 795 ntTSL 217.92■□□□□ 0.463e-9■■■■■ 42.9
FTOQ9C0B1 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.283e-9■■■■■ 42.9
FTOQ9C0B1 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.273e-9■■■■■ 42.9
FTOQ9C0B1 RBPJ-203ENST00000345843 1682 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.063e-9■■■■■ 42.9
FTOQ9C0B1 RBPJ-213ENST00000506956 566 ntTSL 414.55□□□□□ -0.083e-9■■■■■ 42.9
FTOQ9C0B1 RBPJ-224ENST00000513182 537 ntTSL 49.53□□□□□ -0.883e-9■■■■■ 42.9
FTOQ9C0B1 RBPJ-201ENST00000342295 5860 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.993e-9■■■■■ 42.9
FTOQ9C0B1 RBPJ-222ENST00000512351 609 ntTSL 48.39□□□□□ -1.073e-9■■■■■ 42.9
FTOQ9C0B1 RBPJ-225ENST00000514380 1519 ntTSL 27.41□□□□□ -1.223e-9■■■■■ 42.9
FTOQ9C0B1 RBPJ-218ENST00000510778 716 ntTSL 54.64□□□□□ -1.673e-9■■■■■ 42.9
FTOQ9C0B1 RBPJ-219ENST00000511401 577 ntTSL 53.7□□□□□ -1.823e-9■■■■■ 42.9
FTOQ9C0B1 RBPJ-230ENST00000515023 388 ntTSL 52.75□□□□□ -1.973e-9■■■■■ 42.9
FTOQ9C0B1 RBPJ-229ENST00000514807 340 ntTSL 32.69□□□□□ -1.983e-9■■■■■ 42.9
FTOQ9C0B1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.384e-9■■■■■ 42.5
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