Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXR3

ERVK-6, Endogenous retrovirus group K member 6 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-6Q9BXR3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ERVK-6Q9BXR3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ERVK-6Q9BXR3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ERVK-6Q9BXR3 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ERVK-6Q9BXR3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ERVK-6Q9BXR3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ERVK-6Q9BXR3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ERVK-6Q9BXR3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ERVK-6Q9BXR3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ERVK-6Q9BXR3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ERVK-6Q9BXR3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ERVK-6Q9BXR3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ERVK-6Q9BXR3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ERVK-6Q9BXR3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ERVK-6Q9BXR3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ERVK-6Q9BXR3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ERVK-6Q9BXR3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ERVK-6Q9BXR3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ERVK-6Q9BXR3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ERVK-6Q9BXR3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ERVK-6Q9BXR3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERVK-6Q9BXR3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ERVK-6Q9BXR3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ERVK-6Q9BXR3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ERVK-6Q9BXR3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ERVK-6Q9BXR3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ERVK-6Q9BXR3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ERVK-6Q9BXR3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ERVK-6Q9BXR3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ERVK-6Q9BXR3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ERVK-6Q9BXR3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ERVK-6Q9BXR3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ERVK-6Q9BXR3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ERVK-6Q9BXR3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ERVK-6Q9BXR3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ERVK-6Q9BXR3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ERVK-6Q9BXR3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ERVK-6Q9BXR3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ERVK-6Q9BXR3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ERVK-6Q9BXR3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ERVK-6Q9BXR3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ERVK-6Q9BXR3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ERVK-6Q9BXR3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ERVK-6Q9BXR3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ERVK-6Q9BXR3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ERVK-6Q9BXR3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ERVK-6Q9BXR3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ERVK-6Q9BXR3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ERVK-6Q9BXR3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ERVK-6Q9BXR3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ERVK-6Q9BXR3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ERVK-6Q9BXR3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ERVK-6Q9BXR3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ERVK-6Q9BXR3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ERVK-6Q9BXR3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ERVK-6Q9BXR3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ERVK-6Q9BXR3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ERVK-6Q9BXR3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ERVK-6Q9BXR3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ERVK-6Q9BXR3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ERVK-6Q9BXR3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ERVK-6Q9BXR3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ERVK-6Q9BXR3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ERVK-6Q9BXR3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ERVK-6Q9BXR3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ERVK-6Q9BXR3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ERVK-6Q9BXR3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ERVK-6Q9BXR3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ERVK-6Q9BXR3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ERVK-6Q9BXR3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ERVK-6Q9BXR3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ERVK-6Q9BXR3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERVK-6Q9BXR3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERVK-6Q9BXR3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERVK-6Q9BXR3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERVK-6Q9BXR3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ERVK-6Q9BXR3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ERVK-6Q9BXR3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ERVK-6Q9BXR3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERVK-6Q9BXR3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERVK-6Q9BXR3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERVK-6Q9BXR3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERVK-6Q9BXR3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ERVK-6Q9BXR3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ERVK-6Q9BXR3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ERVK-6Q9BXR3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ERVK-6Q9BXR3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ERVK-6Q9BXR3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERVK-6Q9BXR3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ERVK-6Q9BXR3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ERVK-6Q9BXR3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERVK-6Q9BXR3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERVK-6Q9BXR3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERVK-6Q9BXR3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERVK-6Q9BXR3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERVK-6Q9BXR3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERVK-6Q9BXR3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ERVK-6Q9BXR3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERVK-6Q9BXR3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ERVK-6Q9BXR3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 279.7 ms