Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV94

EDEM2, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM2Q9BV94 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
EDEM2Q9BV94 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
EDEM2Q9BV94 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
EDEM2Q9BV94 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
EDEM2Q9BV94 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
EDEM2Q9BV94 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
EDEM2Q9BV94 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
EDEM2Q9BV94 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
EDEM2Q9BV94 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
EDEM2Q9BV94 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
EDEM2Q9BV94 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
EDEM2Q9BV94 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
EDEM2Q9BV94 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
EDEM2Q9BV94 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
EDEM2Q9BV94 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
EDEM2Q9BV94 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
EDEM2Q9BV94 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
EDEM2Q9BV94 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
EDEM2Q9BV94 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
EDEM2Q9BV94 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
EDEM2Q9BV94 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
EDEM2Q9BV94 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
EDEM2Q9BV94 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
EDEM2Q9BV94 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
EDEM2Q9BV94 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
EDEM2Q9BV94 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
EDEM2Q9BV94 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
EDEM2Q9BV94 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
EDEM2Q9BV94 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
EDEM2Q9BV94 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
EDEM2Q9BV94 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EDEM2Q9BV94 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
EDEM2Q9BV94 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
EDEM2Q9BV94 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
EDEM2Q9BV94 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
EDEM2Q9BV94 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
EDEM2Q9BV94 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
EDEM2Q9BV94 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
EDEM2Q9BV94 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
EDEM2Q9BV94 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
EDEM2Q9BV94 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
EDEM2Q9BV94 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
EDEM2Q9BV94 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
EDEM2Q9BV94 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
EDEM2Q9BV94 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
EDEM2Q9BV94 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
EDEM2Q9BV94 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
EDEM2Q9BV94 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
EDEM2Q9BV94 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
EDEM2Q9BV94 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
EDEM2Q9BV94 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
EDEM2Q9BV94 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
EDEM2Q9BV94 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
EDEM2Q9BV94 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
EDEM2Q9BV94 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EDEM2Q9BV94 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EDEM2Q9BV94 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EDEM2Q9BV94 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
EDEM2Q9BV94 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EDEM2Q9BV94 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EDEM2Q9BV94 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EDEM2Q9BV94 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EDEM2Q9BV94 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EDEM2Q9BV94 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
EDEM2Q9BV94 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EDEM2Q9BV94 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EDEM2Q9BV94 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EDEM2Q9BV94 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
EDEM2Q9BV94 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
EDEM2Q9BV94 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EDEM2Q9BV94 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
EDEM2Q9BV94 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EDEM2Q9BV94 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
EDEM2Q9BV94 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EDEM2Q9BV94 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EDEM2Q9BV94 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EDEM2Q9BV94 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EDEM2Q9BV94 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EDEM2Q9BV94 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EDEM2Q9BV94 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EDEM2Q9BV94 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EDEM2Q9BV94 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EDEM2Q9BV94 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EDEM2Q9BV94 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
EDEM2Q9BV94 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EDEM2Q9BV94 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EDEM2Q9BV94 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EDEM2Q9BV94 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EDEM2Q9BV94 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EDEM2Q9BV94 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EDEM2Q9BV94 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EDEM2Q9BV94 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
EDEM2Q9BV94 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EDEM2Q9BV94 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
EDEM2Q9BV94 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
EDEM2Q9BV94 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EDEM2Q9BV94 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
EDEM2Q9BV94 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EDEM2Q9BV94 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EDEM2Q9BV94 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171 ms