Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX3

TMEM208, Transmembrane protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM208Q9BTX3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM208Q9BTX3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM208Q9BTX3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM208Q9BTX3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM208Q9BTX3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM208Q9BTX3 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMEM208Q9BTX3 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM208Q9BTX3 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM208Q9BTX3 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM208Q9BTX3 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM208Q9BTX3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM208Q9BTX3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM208Q9BTX3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM208Q9BTX3 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM208Q9BTX3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM208Q9BTX3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM208Q9BTX3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM208Q9BTX3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM208Q9BTX3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM208Q9BTX3 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM208Q9BTX3 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM208Q9BTX3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM208Q9BTX3 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM208Q9BTX3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM208Q9BTX3 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM208Q9BTX3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM208Q9BTX3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM208Q9BTX3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM208Q9BTX3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM208Q9BTX3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM208Q9BTX3 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM208Q9BTX3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM208Q9BTX3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM208Q9BTX3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM208Q9BTX3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM208Q9BTX3 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM208Q9BTX3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM208Q9BTX3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM208Q9BTX3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM208Q9BTX3 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM208Q9BTX3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM208Q9BTX3 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM208Q9BTX3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM208Q9BTX3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM208Q9BTX3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM208Q9BTX3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM208Q9BTX3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM208Q9BTX3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM208Q9BTX3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM208Q9BTX3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM208Q9BTX3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM208Q9BTX3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM208Q9BTX3 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM208Q9BTX3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM208Q9BTX3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM208Q9BTX3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM208Q9BTX3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM208Q9BTX3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM208Q9BTX3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM208Q9BTX3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM208Q9BTX3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM208Q9BTX3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM208Q9BTX3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM208Q9BTX3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM208Q9BTX3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM208Q9BTX3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM208Q9BTX3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM208Q9BTX3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM208Q9BTX3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM208Q9BTX3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM208Q9BTX3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM208Q9BTX3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM208Q9BTX3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM208Q9BTX3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM208Q9BTX3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM208Q9BTX3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM208Q9BTX3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM208Q9BTX3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM208Q9BTX3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM208Q9BTX3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM208Q9BTX3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM208Q9BTX3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM208Q9BTX3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM208Q9BTX3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM208Q9BTX3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM208Q9BTX3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM208Q9BTX3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM208Q9BTX3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM208Q9BTX3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM208Q9BTX3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM208Q9BTX3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM208Q9BTX3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM208Q9BTX3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEM208Q9BTX3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEM208Q9BTX3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEM208Q9BTX3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM208Q9BTX3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEM208Q9BTX3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEM208Q9BTX3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMEM208Q9BTX3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms