Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NIPSNAP3BQ9BS92 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NIPSNAP3BQ9BS92 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NIPSNAP3BQ9BS92 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NIPSNAP3BQ9BS92 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NIPSNAP3BQ9BS92 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NIPSNAP3BQ9BS92 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NIPSNAP3BQ9BS92 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NIPSNAP3BQ9BS92 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NIPSNAP3BQ9BS92 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NIPSNAP3BQ9BS92 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIPSNAP3BQ9BS92 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIPSNAP3BQ9BS92 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIPSNAP3BQ9BS92 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIPSNAP3BQ9BS92 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NIPSNAP3BQ9BS92 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NIPSNAP3BQ9BS92 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NIPSNAP3BQ9BS92 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NIPSNAP3BQ9BS92 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NIPSNAP3BQ9BS92 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NIPSNAP3BQ9BS92 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NIPSNAP3BQ9BS92 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NIPSNAP3BQ9BS92 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NIPSNAP3BQ9BS92 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NIPSNAP3BQ9BS92 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NIPSNAP3BQ9BS92 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NIPSNAP3BQ9BS92 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NIPSNAP3BQ9BS92 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NIPSNAP3BQ9BS92 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NIPSNAP3BQ9BS92 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NIPSNAP3BQ9BS92 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NIPSNAP3BQ9BS92 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NIPSNAP3BQ9BS92 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NIPSNAP3BQ9BS92 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIPSNAP3BQ9BS92 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIPSNAP3BQ9BS92 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIPSNAP3BQ9BS92 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NIPSNAP3BQ9BS92 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NIPSNAP3BQ9BS92 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NIPSNAP3BQ9BS92 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NIPSNAP3BQ9BS92 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NIPSNAP3BQ9BS92 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NIPSNAP3BQ9BS92 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NIPSNAP3BQ9BS92 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NIPSNAP3BQ9BS92 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NIPSNAP3BQ9BS92 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NIPSNAP3BQ9BS92 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NIPSNAP3BQ9BS92 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIPSNAP3BQ9BS92 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIPSNAP3BQ9BS92 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NIPSNAP3BQ9BS92 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NIPSNAP3BQ9BS92 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIPSNAP3BQ9BS92 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NIPSNAP3BQ9BS92 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NIPSNAP3BQ9BS92 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NIPSNAP3BQ9BS92 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NIPSNAP3BQ9BS92 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NIPSNAP3BQ9BS92 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NIPSNAP3BQ9BS92 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NIPSNAP3BQ9BS92 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIPSNAP3BQ9BS92 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIPSNAP3BQ9BS92 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIPSNAP3BQ9BS92 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NIPSNAP3BQ9BS92 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NIPSNAP3BQ9BS92 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NIPSNAP3BQ9BS92 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NIPSNAP3BQ9BS92 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NIPSNAP3BQ9BS92 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NIPSNAP3BQ9BS92 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NIPSNAP3BQ9BS92 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NIPSNAP3BQ9BS92 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NIPSNAP3BQ9BS92 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NIPSNAP3BQ9BS92 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NIPSNAP3BQ9BS92 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NIPSNAP3BQ9BS92 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIPSNAP3BQ9BS92 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NIPSNAP3BQ9BS92 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NIPSNAP3BQ9BS92 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NIPSNAP3BQ9BS92 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NIPSNAP3BQ9BS92 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NIPSNAP3BQ9BS92 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NIPSNAP3BQ9BS92 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NIPSNAP3BQ9BS92 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIPSNAP3BQ9BS92 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIPSNAP3BQ9BS92 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIPSNAP3BQ9BS92 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIPSNAP3BQ9BS92 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIPSNAP3BQ9BS92 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIPSNAP3BQ9BS92 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NIPSNAP3BQ9BS92 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NIPSNAP3BQ9BS92 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NIPSNAP3BQ9BS92 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NIPSNAP3BQ9BS92 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NIPSNAP3BQ9BS92 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NIPSNAP3BQ9BS92 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIPSNAP3BQ9BS92 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIPSNAP3BQ9BS92 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIPSNAP3BQ9BS92 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms