Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GORASP1Q9BQQ3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GORASP1Q9BQQ3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GORASP1Q9BQQ3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GORASP1Q9BQQ3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GORASP1Q9BQQ3 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GORASP1Q9BQQ3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GORASP1Q9BQQ3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
GORASP1Q9BQQ3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GORASP1Q9BQQ3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GORASP1Q9BQQ3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GORASP1Q9BQQ3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GORASP1Q9BQQ3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GORASP1Q9BQQ3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GORASP1Q9BQQ3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GORASP1Q9BQQ3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GORASP1Q9BQQ3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GORASP1Q9BQQ3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GORASP1Q9BQQ3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GORASP1Q9BQQ3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
GORASP1Q9BQQ3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GORASP1Q9BQQ3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GORASP1Q9BQQ3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GORASP1Q9BQQ3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GORASP1Q9BQQ3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GORASP1Q9BQQ3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GORASP1Q9BQQ3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GORASP1Q9BQQ3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GORASP1Q9BQQ3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GORASP1Q9BQQ3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GORASP1Q9BQQ3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GORASP1Q9BQQ3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GORASP1Q9BQQ3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GORASP1Q9BQQ3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GORASP1Q9BQQ3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GORASP1Q9BQQ3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GORASP1Q9BQQ3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GORASP1Q9BQQ3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GORASP1Q9BQQ3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GORASP1Q9BQQ3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GORASP1Q9BQQ3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GORASP1Q9BQQ3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GORASP1Q9BQQ3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GORASP1Q9BQQ3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GORASP1Q9BQQ3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GORASP1Q9BQQ3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GORASP1Q9BQQ3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GORASP1Q9BQQ3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GORASP1Q9BQQ3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GORASP1Q9BQQ3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GORASP1Q9BQQ3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GORASP1Q9BQQ3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GORASP1Q9BQQ3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GORASP1Q9BQQ3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GORASP1Q9BQQ3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GORASP1Q9BQQ3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GORASP1Q9BQQ3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GORASP1Q9BQQ3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GORASP1Q9BQQ3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GORASP1Q9BQQ3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GORASP1Q9BQQ3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GORASP1Q9BQQ3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GORASP1Q9BQQ3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GORASP1Q9BQQ3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GORASP1Q9BQQ3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GORASP1Q9BQQ3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GORASP1Q9BQQ3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GORASP1Q9BQQ3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GORASP1Q9BQQ3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GORASP1Q9BQQ3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
GORASP1Q9BQQ3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GORASP1Q9BQQ3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GORASP1Q9BQQ3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GORASP1Q9BQQ3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GORASP1Q9BQQ3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GORASP1Q9BQQ3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GORASP1Q9BQQ3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GORASP1Q9BQQ3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GORASP1Q9BQQ3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GORASP1Q9BQQ3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GORASP1Q9BQQ3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GORASP1Q9BQQ3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GORASP1Q9BQQ3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GORASP1Q9BQQ3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GORASP1Q9BQQ3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GORASP1Q9BQQ3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GORASP1Q9BQQ3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GORASP1Q9BQQ3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GORASP1Q9BQQ3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GORASP1Q9BQQ3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GORASP1Q9BQQ3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GORASP1Q9BQQ3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GORASP1Q9BQQ3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
GORASP1Q9BQQ3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GORASP1Q9BQQ3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GORASP1Q9BQQ3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GORASP1Q9BQQ3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
GORASP1Q9BQQ3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GORASP1Q9BQQ3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GORASP1Q9BQQ3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms