Protein–RNA interactions for Protein: Q99PW4

Tp53rk, TP53-regulating kinase, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53rkQ99PW4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tp53rkQ99PW4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tp53rkQ99PW4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tp53rkQ99PW4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tp53rkQ99PW4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tp53rkQ99PW4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tp53rkQ99PW4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tp53rkQ99PW4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tp53rkQ99PW4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tp53rkQ99PW4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Tp53rkQ99PW4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tp53rkQ99PW4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tp53rkQ99PW4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tp53rkQ99PW4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tp53rkQ99PW4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Tp53rkQ99PW4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tp53rkQ99PW4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tp53rkQ99PW4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tp53rkQ99PW4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tp53rkQ99PW4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tp53rkQ99PW4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tp53rkQ99PW4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tp53rkQ99PW4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tp53rkQ99PW4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tp53rkQ99PW4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tp53rkQ99PW4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tp53rkQ99PW4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tp53rkQ99PW4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tp53rkQ99PW4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tp53rkQ99PW4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Tp53rkQ99PW4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tp53rkQ99PW4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tp53rkQ99PW4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tp53rkQ99PW4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tp53rkQ99PW4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tp53rkQ99PW4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tp53rkQ99PW4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Tp53rkQ99PW4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tp53rkQ99PW4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tp53rkQ99PW4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tp53rkQ99PW4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tp53rkQ99PW4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tp53rkQ99PW4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tp53rkQ99PW4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tp53rkQ99PW4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tp53rkQ99PW4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tp53rkQ99PW4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tp53rkQ99PW4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tp53rkQ99PW4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tp53rkQ99PW4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tp53rkQ99PW4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tp53rkQ99PW4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tp53rkQ99PW4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tp53rkQ99PW4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tp53rkQ99PW4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tp53rkQ99PW4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tp53rkQ99PW4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tp53rkQ99PW4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tp53rkQ99PW4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tp53rkQ99PW4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tp53rkQ99PW4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tp53rkQ99PW4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tp53rkQ99PW4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tp53rkQ99PW4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tp53rkQ99PW4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tp53rkQ99PW4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tp53rkQ99PW4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tp53rkQ99PW4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tp53rkQ99PW4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Tp53rkQ99PW4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tp53rkQ99PW4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tp53rkQ99PW4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tp53rkQ99PW4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tp53rkQ99PW4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tp53rkQ99PW4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tp53rkQ99PW4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tp53rkQ99PW4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Tp53rkQ99PW4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Tp53rkQ99PW4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tp53rkQ99PW4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tp53rkQ99PW4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tp53rkQ99PW4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tp53rkQ99PW4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Tp53rkQ99PW4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tp53rkQ99PW4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tp53rkQ99PW4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tp53rkQ99PW4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tp53rkQ99PW4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tp53rkQ99PW4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tp53rkQ99PW4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tp53rkQ99PW4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tp53rkQ99PW4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tp53rkQ99PW4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tp53rkQ99PW4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tp53rkQ99PW4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tp53rkQ99PW4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tp53rkQ99PW4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tp53rkQ99PW4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tp53rkQ99PW4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tp53rkQ99PW4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.3 ms