Protein–RNA interactions for Protein: Q99P69

Nuf2, Kinetochore protein Nuf2, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nuf2Q99P69 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nuf2Q99P69 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nuf2Q99P69 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nuf2Q99P69 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nuf2Q99P69 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Nuf2Q99P69 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nuf2Q99P69 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nuf2Q99P69 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nuf2Q99P69 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nuf2Q99P69 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nuf2Q99P69 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nuf2Q99P69 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nuf2Q99P69 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nuf2Q99P69 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nuf2Q99P69 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nuf2Q99P69 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nuf2Q99P69 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nuf2Q99P69 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nuf2Q99P69 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Nuf2Q99P69 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nuf2Q99P69 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nuf2Q99P69 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nuf2Q99P69 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nuf2Q99P69 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nuf2Q99P69 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nuf2Q99P69 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nuf2Q99P69 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nuf2Q99P69 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nuf2Q99P69 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nuf2Q99P69 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nuf2Q99P69 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Nuf2Q99P69 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nuf2Q99P69 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nuf2Q99P69 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nuf2Q99P69 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nuf2Q99P69 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nuf2Q99P69 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nuf2Q99P69 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nuf2Q99P69 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nuf2Q99P69 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nuf2Q99P69 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nuf2Q99P69 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nuf2Q99P69 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nuf2Q99P69 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nuf2Q99P69 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nuf2Q99P69 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nuf2Q99P69 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nuf2Q99P69 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nuf2Q99P69 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nuf2Q99P69 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nuf2Q99P69 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nuf2Q99P69 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Nuf2Q99P69 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Nuf2Q99P69 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Nuf2Q99P69 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nuf2Q99P69 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nuf2Q99P69 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nuf2Q99P69 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nuf2Q99P69 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nuf2Q99P69 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nuf2Q99P69 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nuf2Q99P69 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nuf2Q99P69 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nuf2Q99P69 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nuf2Q99P69 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nuf2Q99P69 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nuf2Q99P69 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nuf2Q99P69 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nuf2Q99P69 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nuf2Q99P69 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nuf2Q99P69 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Nuf2Q99P69 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nuf2Q99P69 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Nuf2Q99P69 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nuf2Q99P69 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nuf2Q99P69 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nuf2Q99P69 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nuf2Q99P69 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nuf2Q99P69 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nuf2Q99P69 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nuf2Q99P69 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Nuf2Q99P69 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nuf2Q99P69 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nuf2Q99P69 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nuf2Q99P69 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nuf2Q99P69 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Nuf2Q99P69 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nuf2Q99P69 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nuf2Q99P69 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nuf2Q99P69 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nuf2Q99P69 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Nuf2Q99P69 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Nuf2Q99P69 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nuf2Q99P69 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nuf2Q99P69 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Nuf2Q99P69 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nuf2Q99P69 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nuf2Q99P69 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nuf2Q99P69 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nuf2Q99P69 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.6 ms