Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Nus1Q99LJ8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nus1Q99LJ8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nus1Q99LJ8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nus1Q99LJ8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nus1Q99LJ8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nus1Q99LJ8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nus1Q99LJ8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nus1Q99LJ8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nus1Q99LJ8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nus1Q99LJ8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nus1Q99LJ8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nus1Q99LJ8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nus1Q99LJ8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nus1Q99LJ8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nus1Q99LJ8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nus1Q99LJ8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nus1Q99LJ8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nus1Q99LJ8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nus1Q99LJ8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nus1Q99LJ8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nus1Q99LJ8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nus1Q99LJ8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nus1Q99LJ8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nus1Q99LJ8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nus1Q99LJ8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nus1Q99LJ8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nus1Q99LJ8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nus1Q99LJ8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nus1Q99LJ8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nus1Q99LJ8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nus1Q99LJ8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Nus1Q99LJ8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nus1Q99LJ8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nus1Q99LJ8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nus1Q99LJ8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nus1Q99LJ8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nus1Q99LJ8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nus1Q99LJ8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Nus1Q99LJ8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nus1Q99LJ8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nus1Q99LJ8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nus1Q99LJ8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nus1Q99LJ8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Nus1Q99LJ8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nus1Q99LJ8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nus1Q99LJ8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nus1Q99LJ8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nus1Q99LJ8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nus1Q99LJ8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nus1Q99LJ8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nus1Q99LJ8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nus1Q99LJ8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nus1Q99LJ8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nus1Q99LJ8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nus1Q99LJ8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nus1Q99LJ8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nus1Q99LJ8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nus1Q99LJ8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nus1Q99LJ8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Nus1Q99LJ8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nus1Q99LJ8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nus1Q99LJ8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nus1Q99LJ8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nus1Q99LJ8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Nus1Q99LJ8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nus1Q99LJ8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nus1Q99LJ8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nus1Q99LJ8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Nus1Q99LJ8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nus1Q99LJ8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nus1Q99LJ8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nus1Q99LJ8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nus1Q99LJ8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nus1Q99LJ8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nus1Q99LJ8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Nus1Q99LJ8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nus1Q99LJ8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nus1Q99LJ8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nus1Q99LJ8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Nus1Q99LJ8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nus1Q99LJ8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nus1Q99LJ8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nus1Q99LJ8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nus1Q99LJ8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nus1Q99LJ8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nus1Q99LJ8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nus1Q99LJ8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nus1Q99LJ8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nus1Q99LJ8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nus1Q99LJ8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nus1Q99LJ8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nus1Q99LJ8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nus1Q99LJ8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nus1Q99LJ8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nus1Q99LJ8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nus1Q99LJ8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Nus1Q99LJ8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nus1Q99LJ8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nus1Q99LJ8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms