Protein–RNA interactions for Protein: Q99K23

Ufsp2, Ufm1-specific protease 2, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufsp2Q99K23 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ufsp2Q99K23 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ufsp2Q99K23 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ufsp2Q99K23 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ufsp2Q99K23 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ufsp2Q99K23 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ufsp2Q99K23 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ufsp2Q99K23 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ufsp2Q99K23 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ufsp2Q99K23 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ufsp2Q99K23 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ufsp2Q99K23 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ufsp2Q99K23 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ufsp2Q99K23 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ufsp2Q99K23 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ufsp2Q99K23 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ufsp2Q99K23 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ufsp2Q99K23 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ufsp2Q99K23 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ufsp2Q99K23 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ufsp2Q99K23 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ufsp2Q99K23 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ufsp2Q99K23 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ufsp2Q99K23 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ufsp2Q99K23 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ufsp2Q99K23 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ufsp2Q99K23 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ufsp2Q99K23 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ufsp2Q99K23 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ufsp2Q99K23 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ufsp2Q99K23 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ufsp2Q99K23 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ufsp2Q99K23 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ufsp2Q99K23 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ufsp2Q99K23 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ufsp2Q99K23 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ufsp2Q99K23 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Ufsp2Q99K23 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ufsp2Q99K23 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ufsp2Q99K23 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ufsp2Q99K23 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ufsp2Q99K23 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ufsp2Q99K23 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ufsp2Q99K23 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ufsp2Q99K23 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ufsp2Q99K23 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ufsp2Q99K23 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ufsp2Q99K23 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ufsp2Q99K23 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ufsp2Q99K23 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ufsp2Q99K23 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ufsp2Q99K23 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ufsp2Q99K23 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ufsp2Q99K23 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ufsp2Q99K23 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ufsp2Q99K23 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ufsp2Q99K23 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ufsp2Q99K23 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ufsp2Q99K23 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ufsp2Q99K23 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ufsp2Q99K23 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ufsp2Q99K23 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ufsp2Q99K23 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ufsp2Q99K23 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ufsp2Q99K23 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ufsp2Q99K23 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ufsp2Q99K23 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ufsp2Q99K23 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ufsp2Q99K23 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ufsp2Q99K23 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ufsp2Q99K23 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ufsp2Q99K23 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ufsp2Q99K23 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ufsp2Q99K23 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ufsp2Q99K23 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ufsp2Q99K23 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ufsp2Q99K23 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ufsp2Q99K23 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ufsp2Q99K23 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ufsp2Q99K23 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ufsp2Q99K23 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ufsp2Q99K23 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ufsp2Q99K23 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ufsp2Q99K23 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ufsp2Q99K23 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ufsp2Q99K23 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ufsp2Q99K23 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ufsp2Q99K23 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ufsp2Q99K23 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ufsp2Q99K23 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ufsp2Q99K23 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ufsp2Q99K23 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ufsp2Q99K23 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ufsp2Q99K23 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ufsp2Q99K23 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ufsp2Q99K23 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ufsp2Q99K23 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ufsp2Q99K23 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ufsp2Q99K23 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ufsp2Q99K23 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 175.2 ms