Protein–RNA interactions for Protein: Q99865

SPIN2A, Spindlin-2A, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN2AQ99865 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPIN2AQ99865 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPIN2AQ99865 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPIN2AQ99865 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPIN2AQ99865 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPIN2AQ99865 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPIN2AQ99865 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPIN2AQ99865 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPIN2AQ99865 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPIN2AQ99865 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPIN2AQ99865 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPIN2AQ99865 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SPIN2AQ99865 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPIN2AQ99865 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPIN2AQ99865 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPIN2AQ99865 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPIN2AQ99865 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPIN2AQ99865 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPIN2AQ99865 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPIN2AQ99865 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPIN2AQ99865 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPIN2AQ99865 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPIN2AQ99865 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPIN2AQ99865 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPIN2AQ99865 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPIN2AQ99865 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPIN2AQ99865 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPIN2AQ99865 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPIN2AQ99865 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPIN2AQ99865 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPIN2AQ99865 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPIN2AQ99865 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPIN2AQ99865 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPIN2AQ99865 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPIN2AQ99865 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPIN2AQ99865 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPIN2AQ99865 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPIN2AQ99865 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPIN2AQ99865 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPIN2AQ99865 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPIN2AQ99865 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPIN2AQ99865 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPIN2AQ99865 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPIN2AQ99865 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPIN2AQ99865 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPIN2AQ99865 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPIN2AQ99865 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPIN2AQ99865 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPIN2AQ99865 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPIN2AQ99865 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPIN2AQ99865 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPIN2AQ99865 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPIN2AQ99865 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPIN2AQ99865 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPIN2AQ99865 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPIN2AQ99865 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPIN2AQ99865 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPIN2AQ99865 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SPIN2AQ99865 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPIN2AQ99865 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPIN2AQ99865 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPIN2AQ99865 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPIN2AQ99865 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPIN2AQ99865 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPIN2AQ99865 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPIN2AQ99865 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPIN2AQ99865 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPIN2AQ99865 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPIN2AQ99865 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPIN2AQ99865 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPIN2AQ99865 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPIN2AQ99865 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPIN2AQ99865 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPIN2AQ99865 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPIN2AQ99865 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPIN2AQ99865 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPIN2AQ99865 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPIN2AQ99865 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPIN2AQ99865 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPIN2AQ99865 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPIN2AQ99865 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPIN2AQ99865 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPIN2AQ99865 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPIN2AQ99865 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPIN2AQ99865 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPIN2AQ99865 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPIN2AQ99865 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPIN2AQ99865 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPIN2AQ99865 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPIN2AQ99865 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPIN2AQ99865 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPIN2AQ99865 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPIN2AQ99865 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPIN2AQ99865 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPIN2AQ99865 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPIN2AQ99865 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPIN2AQ99865 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPIN2AQ99865 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPIN2AQ99865 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPIN2AQ99865 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms