Protein–RNA interactions for Protein: Q99614

TTC1, Tetratricopeptide repeat protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC1Q99614 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TTC1Q99614 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TTC1Q99614 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TTC1Q99614 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TTC1Q99614 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TTC1Q99614 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TTC1Q99614 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TTC1Q99614 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TTC1Q99614 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TTC1Q99614 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TTC1Q99614 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TTC1Q99614 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TTC1Q99614 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TTC1Q99614 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TTC1Q99614 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TTC1Q99614 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TTC1Q99614 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TTC1Q99614 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TTC1Q99614 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TTC1Q99614 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TTC1Q99614 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TTC1Q99614 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TTC1Q99614 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TTC1Q99614 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TTC1Q99614 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TTC1Q99614 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TTC1Q99614 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TTC1Q99614 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TTC1Q99614 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TTC1Q99614 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TTC1Q99614 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TTC1Q99614 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TTC1Q99614 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TTC1Q99614 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TTC1Q99614 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TTC1Q99614 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TTC1Q99614 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TTC1Q99614 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TTC1Q99614 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TTC1Q99614 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TTC1Q99614 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
TTC1Q99614 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TTC1Q99614 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TTC1Q99614 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TTC1Q99614 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TTC1Q99614 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TTC1Q99614 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TTC1Q99614 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TTC1Q99614 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TTC1Q99614 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TTC1Q99614 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTC1Q99614 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTC1Q99614 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTC1Q99614 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TTC1Q99614 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TTC1Q99614 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TTC1Q99614 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TTC1Q99614 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TTC1Q99614 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TTC1Q99614 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TTC1Q99614 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TTC1Q99614 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TTC1Q99614 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TTC1Q99614 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TTC1Q99614 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TTC1Q99614 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TTC1Q99614 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TTC1Q99614 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TTC1Q99614 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TTC1Q99614 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TTC1Q99614 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TTC1Q99614 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TTC1Q99614 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TTC1Q99614 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TTC1Q99614 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TTC1Q99614 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TTC1Q99614 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TTC1Q99614 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TTC1Q99614 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TTC1Q99614 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TTC1Q99614 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TTC1Q99614 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TTC1Q99614 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
TTC1Q99614 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TTC1Q99614 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TTC1Q99614 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TTC1Q99614 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TTC1Q99614 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TTC1Q99614 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TTC1Q99614 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TTC1Q99614 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TTC1Q99614 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TTC1Q99614 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TTC1Q99614 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TTC1Q99614 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TTC1Q99614 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TTC1Q99614 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TTC1Q99614 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TTC1Q99614 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TTC1Q99614 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms