Protein–RNA interactions for Protein: Q96S66

CLCC1, Chloride channel CLIC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCC1Q96S66 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLCC1Q96S66 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLCC1Q96S66 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLCC1Q96S66 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLCC1Q96S66 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLCC1Q96S66 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLCC1Q96S66 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLCC1Q96S66 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLCC1Q96S66 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLCC1Q96S66 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLCC1Q96S66 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLCC1Q96S66 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLCC1Q96S66 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLCC1Q96S66 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLCC1Q96S66 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLCC1Q96S66 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLCC1Q96S66 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLCC1Q96S66 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLCC1Q96S66 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLCC1Q96S66 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLCC1Q96S66 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLCC1Q96S66 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLCC1Q96S66 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLCC1Q96S66 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLCC1Q96S66 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLCC1Q96S66 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLCC1Q96S66 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLCC1Q96S66 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CLCC1Q96S66 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLCC1Q96S66 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLCC1Q96S66 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLCC1Q96S66 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLCC1Q96S66 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLCC1Q96S66 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLCC1Q96S66 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLCC1Q96S66 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLCC1Q96S66 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLCC1Q96S66 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLCC1Q96S66 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLCC1Q96S66 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLCC1Q96S66 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLCC1Q96S66 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLCC1Q96S66 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLCC1Q96S66 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLCC1Q96S66 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLCC1Q96S66 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLCC1Q96S66 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLCC1Q96S66 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLCC1Q96S66 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLCC1Q96S66 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLCC1Q96S66 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLCC1Q96S66 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CLCC1Q96S66 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLCC1Q96S66 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLCC1Q96S66 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLCC1Q96S66 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLCC1Q96S66 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLCC1Q96S66 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLCC1Q96S66 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLCC1Q96S66 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLCC1Q96S66 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLCC1Q96S66 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLCC1Q96S66 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLCC1Q96S66 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLCC1Q96S66 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLCC1Q96S66 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLCC1Q96S66 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLCC1Q96S66 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLCC1Q96S66 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLCC1Q96S66 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLCC1Q96S66 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLCC1Q96S66 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CLCC1Q96S66 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLCC1Q96S66 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLCC1Q96S66 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLCC1Q96S66 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLCC1Q96S66 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLCC1Q96S66 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLCC1Q96S66 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLCC1Q96S66 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLCC1Q96S66 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLCC1Q96S66 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLCC1Q96S66 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CLCC1Q96S66 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLCC1Q96S66 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLCC1Q96S66 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLCC1Q96S66 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLCC1Q96S66 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLCC1Q96S66 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLCC1Q96S66 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLCC1Q96S66 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLCC1Q96S66 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLCC1Q96S66 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLCC1Q96S66 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLCC1Q96S66 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLCC1Q96S66 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CLCC1Q96S66 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLCC1Q96S66 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLCC1Q96S66 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLCC1Q96S66 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms