Protein–RNA interactions for Protein: Q96QV6

HIST1H2AA, Histone H2A type 1-A, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST1H2AAQ96QV6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HIST1H2AAQ96QV6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HIST1H2AAQ96QV6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HIST1H2AAQ96QV6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HIST1H2AAQ96QV6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HIST1H2AAQ96QV6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HIST1H2AAQ96QV6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HIST1H2AAQ96QV6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HIST1H2AAQ96QV6 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HIST1H2AAQ96QV6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HIST1H2AAQ96QV6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HIST1H2AAQ96QV6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HIST1H2AAQ96QV6 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HIST1H2AAQ96QV6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HIST1H2AAQ96QV6 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HIST1H2AAQ96QV6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HIST1H2AAQ96QV6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HIST1H2AAQ96QV6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HIST1H2AAQ96QV6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HIST1H2AAQ96QV6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HIST1H2AAQ96QV6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HIST1H2AAQ96QV6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HIST1H2AAQ96QV6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HIST1H2AAQ96QV6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HIST1H2AAQ96QV6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HIST1H2AAQ96QV6 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIST1H2AAQ96QV6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HIST1H2AAQ96QV6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HIST1H2AAQ96QV6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HIST1H2AAQ96QV6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HIST1H2AAQ96QV6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HIST1H2AAQ96QV6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIST1H2AAQ96QV6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIST1H2AAQ96QV6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIST1H2AAQ96QV6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIST1H2AAQ96QV6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIST1H2AAQ96QV6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HIST1H2AAQ96QV6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HIST1H2AAQ96QV6 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HIST1H2AAQ96QV6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIST1H2AAQ96QV6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HIST1H2AAQ96QV6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HIST1H2AAQ96QV6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIST1H2AAQ96QV6 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HIST1H2AAQ96QV6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIST1H2AAQ96QV6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIST1H2AAQ96QV6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIST1H2AAQ96QV6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HIST1H2AAQ96QV6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIST1H2AAQ96QV6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIST1H2AAQ96QV6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIST1H2AAQ96QV6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIST1H2AAQ96QV6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIST1H2AAQ96QV6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIST1H2AAQ96QV6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HIST1H2AAQ96QV6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HIST1H2AAQ96QV6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIST1H2AAQ96QV6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIST1H2AAQ96QV6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIST1H2AAQ96QV6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIST1H2AAQ96QV6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HIST1H2AAQ96QV6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HIST1H2AAQ96QV6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HIST1H2AAQ96QV6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HIST1H2AAQ96QV6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HIST1H2AAQ96QV6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HIST1H2AAQ96QV6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HIST1H2AAQ96QV6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIST1H2AAQ96QV6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HIST1H2AAQ96QV6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HIST1H2AAQ96QV6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HIST1H2AAQ96QV6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIST1H2AAQ96QV6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HIST1H2AAQ96QV6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HIST1H2AAQ96QV6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HIST1H2AAQ96QV6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HIST1H2AAQ96QV6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HIST1H2AAQ96QV6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HIST1H2AAQ96QV6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HIST1H2AAQ96QV6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HIST1H2AAQ96QV6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HIST1H2AAQ96QV6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HIST1H2AAQ96QV6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HIST1H2AAQ96QV6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HIST1H2AAQ96QV6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HIST1H2AAQ96QV6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HIST1H2AAQ96QV6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HIST1H2AAQ96QV6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HIST1H2AAQ96QV6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HIST1H2AAQ96QV6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HIST1H2AAQ96QV6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HIST1H2AAQ96QV6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HIST1H2AAQ96QV6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HIST1H2AAQ96QV6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIST1H2AAQ96QV6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIST1H2AAQ96QV6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIST1H2AAQ96QV6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HIST1H2AAQ96QV6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HIST1H2AAQ96QV6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HIST1H2AAQ96QV6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms