Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD5

DEPDC7, DEP domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC7Q96QD5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DEPDC7Q96QD5 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DEPDC7Q96QD5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DEPDC7Q96QD5 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DEPDC7Q96QD5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DEPDC7Q96QD5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DEPDC7Q96QD5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DEPDC7Q96QD5 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DEPDC7Q96QD5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DEPDC7Q96QD5 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
DEPDC7Q96QD5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
DEPDC7Q96QD5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DEPDC7Q96QD5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DEPDC7Q96QD5 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DEPDC7Q96QD5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DEPDC7Q96QD5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DEPDC7Q96QD5 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DEPDC7Q96QD5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DEPDC7Q96QD5 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DEPDC7Q96QD5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DEPDC7Q96QD5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DEPDC7Q96QD5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DEPDC7Q96QD5 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DEPDC7Q96QD5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
DEPDC7Q96QD5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DEPDC7Q96QD5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DEPDC7Q96QD5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DEPDC7Q96QD5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DEPDC7Q96QD5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DEPDC7Q96QD5 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DEPDC7Q96QD5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
DEPDC7Q96QD5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DEPDC7Q96QD5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DEPDC7Q96QD5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DEPDC7Q96QD5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DEPDC7Q96QD5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DEPDC7Q96QD5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DEPDC7Q96QD5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DEPDC7Q96QD5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DEPDC7Q96QD5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DEPDC7Q96QD5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DEPDC7Q96QD5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
DEPDC7Q96QD5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DEPDC7Q96QD5 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DEPDC7Q96QD5 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DEPDC7Q96QD5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DEPDC7Q96QD5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
DEPDC7Q96QD5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DEPDC7Q96QD5 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DEPDC7Q96QD5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DEPDC7Q96QD5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DEPDC7Q96QD5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DEPDC7Q96QD5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DEPDC7Q96QD5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
DEPDC7Q96QD5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DEPDC7Q96QD5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DEPDC7Q96QD5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DEPDC7Q96QD5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DEPDC7Q96QD5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DEPDC7Q96QD5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DEPDC7Q96QD5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DEPDC7Q96QD5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DEPDC7Q96QD5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.54■■■□□ 2
DEPDC7Q96QD5 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
DEPDC7Q96QD5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DEPDC7Q96QD5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DEPDC7Q96QD5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DEPDC7Q96QD5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DEPDC7Q96QD5 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DEPDC7Q96QD5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DEPDC7Q96QD5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DEPDC7Q96QD5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DEPDC7Q96QD5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DEPDC7Q96QD5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DEPDC7Q96QD5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
DEPDC7Q96QD5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DEPDC7Q96QD5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DEPDC7Q96QD5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DEPDC7Q96QD5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DEPDC7Q96QD5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DEPDC7Q96QD5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DEPDC7Q96QD5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DEPDC7Q96QD5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DEPDC7Q96QD5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DEPDC7Q96QD5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DEPDC7Q96QD5 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DEPDC7Q96QD5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DEPDC7Q96QD5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DEPDC7Q96QD5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DEPDC7Q96QD5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DEPDC7Q96QD5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DEPDC7Q96QD5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
DEPDC7Q96QD5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DEPDC7Q96QD5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
DEPDC7Q96QD5 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DEPDC7Q96QD5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DEPDC7Q96QD5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DEPDC7Q96QD5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DEPDC7Q96QD5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DEPDC7Q96QD5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms