Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CAPZA3Q96KX2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CAPZA3Q96KX2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CAPZA3Q96KX2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CAPZA3Q96KX2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
CAPZA3Q96KX2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CAPZA3Q96KX2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CAPZA3Q96KX2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CAPZA3Q96KX2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CAPZA3Q96KX2 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CAPZA3Q96KX2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CAPZA3Q96KX2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CAPZA3Q96KX2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
CAPZA3Q96KX2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CAPZA3Q96KX2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CAPZA3Q96KX2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CAPZA3Q96KX2 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CAPZA3Q96KX2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CAPZA3Q96KX2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CAPZA3Q96KX2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CAPZA3Q96KX2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CAPZA3Q96KX2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CAPZA3Q96KX2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CAPZA3Q96KX2 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CAPZA3Q96KX2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CAPZA3Q96KX2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CAPZA3Q96KX2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CAPZA3Q96KX2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CAPZA3Q96KX2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CAPZA3Q96KX2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CAPZA3Q96KX2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CAPZA3Q96KX2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CAPZA3Q96KX2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CAPZA3Q96KX2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CAPZA3Q96KX2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CAPZA3Q96KX2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CAPZA3Q96KX2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CAPZA3Q96KX2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CAPZA3Q96KX2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CAPZA3Q96KX2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CAPZA3Q96KX2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CAPZA3Q96KX2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CAPZA3Q96KX2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CAPZA3Q96KX2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CAPZA3Q96KX2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CAPZA3Q96KX2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CAPZA3Q96KX2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CAPZA3Q96KX2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CAPZA3Q96KX2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CAPZA3Q96KX2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CAPZA3Q96KX2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CAPZA3Q96KX2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CAPZA3Q96KX2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CAPZA3Q96KX2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CAPZA3Q96KX2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CAPZA3Q96KX2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CAPZA3Q96KX2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CAPZA3Q96KX2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CAPZA3Q96KX2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CAPZA3Q96KX2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CAPZA3Q96KX2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CAPZA3Q96KX2 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CAPZA3Q96KX2 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CAPZA3Q96KX2 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CAPZA3Q96KX2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CAPZA3Q96KX2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CAPZA3Q96KX2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CAPZA3Q96KX2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CAPZA3Q96KX2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CAPZA3Q96KX2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CAPZA3Q96KX2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CAPZA3Q96KX2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CAPZA3Q96KX2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CAPZA3Q96KX2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CAPZA3Q96KX2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
CAPZA3Q96KX2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CAPZA3Q96KX2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CAPZA3Q96KX2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CAPZA3Q96KX2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CAPZA3Q96KX2 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CAPZA3Q96KX2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CAPZA3Q96KX2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CAPZA3Q96KX2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CAPZA3Q96KX2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CAPZA3Q96KX2 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CAPZA3Q96KX2 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CAPZA3Q96KX2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CAPZA3Q96KX2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CAPZA3Q96KX2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CAPZA3Q96KX2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CAPZA3Q96KX2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CAPZA3Q96KX2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CAPZA3Q96KX2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CAPZA3Q96KX2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CAPZA3Q96KX2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CAPZA3Q96KX2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CAPZA3Q96KX2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CAPZA3Q96KX2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CAPZA3Q96KX2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CAPZA3Q96KX2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms