Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PGBD1Q96JS3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PGBD1Q96JS3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PGBD1Q96JS3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PGBD1Q96JS3 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PGBD1Q96JS3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PGBD1Q96JS3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
PGBD1Q96JS3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PGBD1Q96JS3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PGBD1Q96JS3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PGBD1Q96JS3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PGBD1Q96JS3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PGBD1Q96JS3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PGBD1Q96JS3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PGBD1Q96JS3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PGBD1Q96JS3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC33.2■■■□□ 2.9
PGBD1Q96JS3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
PGBD1Q96JS3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PGBD1Q96JS3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PGBD1Q96JS3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PGBD1Q96JS3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PGBD1Q96JS3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
PGBD1Q96JS3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PGBD1Q96JS3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PGBD1Q96JS3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PGBD1Q96JS3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
PGBD1Q96JS3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PGBD1Q96JS3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PGBD1Q96JS3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PGBD1Q96JS3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PGBD1Q96JS3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
PGBD1Q96JS3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
PGBD1Q96JS3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC33■■■□□ 2.87
PGBD1Q96JS3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PGBD1Q96JS3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PGBD1Q96JS3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PGBD1Q96JS3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
PGBD1Q96JS3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PGBD1Q96JS3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PGBD1Q96JS3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
PGBD1Q96JS3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PGBD1Q96JS3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PGBD1Q96JS3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PGBD1Q96JS3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PGBD1Q96JS3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PGBD1Q96JS3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PGBD1Q96JS3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PGBD1Q96JS3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PGBD1Q96JS3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
PGBD1Q96JS3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PGBD1Q96JS3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PGBD1Q96JS3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PGBD1Q96JS3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PGBD1Q96JS3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PGBD1Q96JS3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PGBD1Q96JS3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PGBD1Q96JS3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
PGBD1Q96JS3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PGBD1Q96JS3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PGBD1Q96JS3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PGBD1Q96JS3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PGBD1Q96JS3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PGBD1Q96JS3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PGBD1Q96JS3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PGBD1Q96JS3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PGBD1Q96JS3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
PGBD1Q96JS3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PGBD1Q96JS3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PGBD1Q96JS3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PGBD1Q96JS3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
PGBD1Q96JS3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PGBD1Q96JS3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
PGBD1Q96JS3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PGBD1Q96JS3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PGBD1Q96JS3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PGBD1Q96JS3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PGBD1Q96JS3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PGBD1Q96JS3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PGBD1Q96JS3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PGBD1Q96JS3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PGBD1Q96JS3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PGBD1Q96JS3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PGBD1Q96JS3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PGBD1Q96JS3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PGBD1Q96JS3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PGBD1Q96JS3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PGBD1Q96JS3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PGBD1Q96JS3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PGBD1Q96JS3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PGBD1Q96JS3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PGBD1Q96JS3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PGBD1Q96JS3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PGBD1Q96JS3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
PGBD1Q96JS3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PGBD1Q96JS3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PGBD1Q96JS3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PGBD1Q96JS3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PGBD1Q96JS3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PGBD1Q96JS3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PGBD1Q96JS3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.3 ms