Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN8

NEURL4, Neuralized-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL4Q96JN8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.34■■■■■ 4.53
NEURL4Q96JN8 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.34■■■■■ 4.53
NEURL4Q96JN8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC43.33■■■■■ 4.53
NEURL4Q96JN8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
NEURL4Q96JN8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC43.27■■■■■ 4.52
NEURL4Q96JN8 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.25■■■■■ 4.51
NEURL4Q96JN8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
NEURL4Q96JN8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC43.23■■■■■ 4.51
NEURL4Q96JN8 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
NEURL4Q96JN8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
NEURL4Q96JN8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC43.16■■■■■ 4.5
NEURL4Q96JN8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC43.16■■■■■ 4.5
NEURL4Q96JN8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
NEURL4Q96JN8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
NEURL4Q96JN8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC43.11■■■■■ 4.49
NEURL4Q96JN8 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.03■■■■■ 4.48
NEURL4Q96JN8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
NEURL4Q96JN8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC42.97■■■■■ 4.47
NEURL4Q96JN8 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC42.93■■■■■ 4.46
NEURL4Q96JN8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC42.87■■■■■ 4.45
NEURL4Q96JN8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
NEURL4Q96JN8 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
NEURL4Q96JN8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC42.78■■■■■ 4.44
NEURL4Q96JN8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC42.76■■■■■ 4.44
NEURL4Q96JN8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC42.73■■■■■ 4.43
NEURL4Q96JN8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC42.67■■■■■ 4.42
NEURL4Q96JN8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC42.61■■■■■ 4.41
NEURL4Q96JN8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
NEURL4Q96JN8 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.54■■■■■ 4.4
NEURL4Q96JN8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.52■■■■■ 4.4
NEURL4Q96JN8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC42.49■■■■■ 4.39
NEURL4Q96JN8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
NEURL4Q96JN8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC42.44■■■■■ 4.39
NEURL4Q96JN8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
NEURL4Q96JN8 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
NEURL4Q96JN8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
NEURL4Q96JN8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
NEURL4Q96JN8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
NEURL4Q96JN8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
NEURL4Q96JN8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC42.34■■■■■ 4.37
NEURL4Q96JN8 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC42.33■■■■■ 4.37
NEURL4Q96JN8 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.36
NEURL4Q96JN8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
NEURL4Q96JN8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
NEURL4Q96JN8 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
NEURL4Q96JN8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC42.22■■■■■ 4.35
NEURL4Q96JN8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
NEURL4Q96JN8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.22■■■■■ 4.35
NEURL4Q96JN8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC42.21■■■■■ 4.35
NEURL4Q96JN8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
NEURL4Q96JN8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC42.17■■■■■ 4.34
NEURL4Q96JN8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC42.15■■■■■ 4.34
NEURL4Q96JN8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC42.11■■■■■ 4.33
NEURL4Q96JN8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC42.1■■■■■ 4.33
NEURL4Q96JN8 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.09■■■■■ 4.33
NEURL4Q96JN8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC42.09■■■■■ 4.33
NEURL4Q96JN8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC42.05■■■■■ 4.32
NEURL4Q96JN8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
NEURL4Q96JN8 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
NEURL4Q96JN8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC41.96■■■■■ 4.31
NEURL4Q96JN8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC41.95■■■■■ 4.31
NEURL4Q96JN8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC41.95■■■■■ 4.31
NEURL4Q96JN8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC41.94■■■■■ 4.3
NEURL4Q96JN8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC41.93■■■■■ 4.3
NEURL4Q96JN8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC41.93■■■■■ 4.3
NEURL4Q96JN8 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
NEURL4Q96JN8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
NEURL4Q96JN8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.84■■■■■ 4.29
NEURL4Q96JN8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC41.8■■■■■ 4.28
NEURL4Q96JN8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
NEURL4Q96JN8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
NEURL4Q96JN8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
NEURL4Q96JN8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC41.74■■■■■ 4.27
NEURL4Q96JN8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC41.71■■■■■ 4.27
NEURL4Q96JN8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.7■■■■■ 4.27
NEURL4Q96JN8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC41.7■■■■■ 4.27
NEURL4Q96JN8 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
NEURL4Q96JN8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
NEURL4Q96JN8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.67■■■■■ 4.26
NEURL4Q96JN8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
NEURL4Q96JN8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC41.64■■■■■ 4.26
NEURL4Q96JN8 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
NEURL4Q96JN8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
NEURL4Q96JN8 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC41.6■■■■■ 4.25
NEURL4Q96JN8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC41.6■■■■■ 4.25
NEURL4Q96JN8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.57■■■■■ 4.25
NEURL4Q96JN8 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
NEURL4Q96JN8 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
NEURL4Q96JN8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
NEURL4Q96JN8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
NEURL4Q96JN8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
NEURL4Q96JN8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
NEURL4Q96JN8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC41.47■■■■■ 4.23
NEURL4Q96JN8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
NEURL4Q96JN8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC41.46■■■■■ 4.23
NEURL4Q96JN8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC41.45■■■■■ 4.23
NEURL4Q96JN8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
NEURL4Q96JN8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
NEURL4Q96JN8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
NEURL4Q96JN8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC41.4■■■■■ 4.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms