Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC4

ZNF479, Zinc finger protein 479, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF479Q96JC4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF479Q96JC4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF479Q96JC4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF479Q96JC4 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF479Q96JC4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF479Q96JC4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF479Q96JC4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF479Q96JC4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF479Q96JC4 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF479Q96JC4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF479Q96JC4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNF479Q96JC4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNF479Q96JC4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNF479Q96JC4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNF479Q96JC4 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ZNF479Q96JC4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZNF479Q96JC4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZNF479Q96JC4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZNF479Q96JC4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF479Q96JC4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF479Q96JC4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF479Q96JC4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF479Q96JC4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF479Q96JC4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF479Q96JC4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF479Q96JC4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF479Q96JC4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF479Q96JC4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF479Q96JC4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF479Q96JC4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF479Q96JC4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF479Q96JC4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF479Q96JC4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF479Q96JC4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF479Q96JC4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF479Q96JC4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF479Q96JC4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF479Q96JC4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF479Q96JC4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF479Q96JC4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF479Q96JC4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF479Q96JC4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF479Q96JC4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF479Q96JC4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF479Q96JC4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF479Q96JC4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF479Q96JC4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF479Q96JC4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF479Q96JC4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF479Q96JC4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF479Q96JC4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNF479Q96JC4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNF479Q96JC4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNF479Q96JC4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF479Q96JC4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF479Q96JC4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF479Q96JC4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF479Q96JC4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF479Q96JC4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF479Q96JC4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF479Q96JC4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF479Q96JC4 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF479Q96JC4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF479Q96JC4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF479Q96JC4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF479Q96JC4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF479Q96JC4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF479Q96JC4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF479Q96JC4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF479Q96JC4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF479Q96JC4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF479Q96JC4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF479Q96JC4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF479Q96JC4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF479Q96JC4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF479Q96JC4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF479Q96JC4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF479Q96JC4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF479Q96JC4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF479Q96JC4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF479Q96JC4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF479Q96JC4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF479Q96JC4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF479Q96JC4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF479Q96JC4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF479Q96JC4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF479Q96JC4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF479Q96JC4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF479Q96JC4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF479Q96JC4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF479Q96JC4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF479Q96JC4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF479Q96JC4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF479Q96JC4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF479Q96JC4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF479Q96JC4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF479Q96JC4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF479Q96JC4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF479Q96JC4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF479Q96JC4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105 ms