Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HIC2Q96JB3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HIC2Q96JB3 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HIC2Q96JB3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HIC2Q96JB3 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HIC2Q96JB3 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HIC2Q96JB3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HIC2Q96JB3 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HIC2Q96JB3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HIC2Q96JB3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
HIC2Q96JB3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HIC2Q96JB3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HIC2Q96JB3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HIC2Q96JB3 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HIC2Q96JB3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HIC2Q96JB3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HIC2Q96JB3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HIC2Q96JB3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HIC2Q96JB3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HIC2Q96JB3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HIC2Q96JB3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
HIC2Q96JB3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
HIC2Q96JB3 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HIC2Q96JB3 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HIC2Q96JB3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HIC2Q96JB3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HIC2Q96JB3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HIC2Q96JB3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HIC2Q96JB3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HIC2Q96JB3 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HIC2Q96JB3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HIC2Q96JB3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HIC2Q96JB3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HIC2Q96JB3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HIC2Q96JB3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HIC2Q96JB3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HIC2Q96JB3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
HIC2Q96JB3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
HIC2Q96JB3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HIC2Q96JB3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HIC2Q96JB3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
HIC2Q96JB3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HIC2Q96JB3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
HIC2Q96JB3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HIC2Q96JB3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HIC2Q96JB3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HIC2Q96JB3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HIC2Q96JB3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HIC2Q96JB3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HIC2Q96JB3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HIC2Q96JB3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HIC2Q96JB3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HIC2Q96JB3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HIC2Q96JB3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HIC2Q96JB3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HIC2Q96JB3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HIC2Q96JB3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HIC2Q96JB3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HIC2Q96JB3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HIC2Q96JB3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HIC2Q96JB3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HIC2Q96JB3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HIC2Q96JB3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HIC2Q96JB3 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
HIC2Q96JB3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
HIC2Q96JB3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HIC2Q96JB3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HIC2Q96JB3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HIC2Q96JB3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HIC2Q96JB3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HIC2Q96JB3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HIC2Q96JB3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HIC2Q96JB3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HIC2Q96JB3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HIC2Q96JB3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HIC2Q96JB3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HIC2Q96JB3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HIC2Q96JB3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HIC2Q96JB3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HIC2Q96JB3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HIC2Q96JB3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HIC2Q96JB3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HIC2Q96JB3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HIC2Q96JB3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HIC2Q96JB3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HIC2Q96JB3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HIC2Q96JB3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HIC2Q96JB3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HIC2Q96JB3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HIC2Q96JB3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HIC2Q96JB3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HIC2Q96JB3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HIC2Q96JB3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
HIC2Q96JB3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HIC2Q96JB3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HIC2Q96JB3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HIC2Q96JB3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HIC2Q96JB3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HIC2Q96JB3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HIC2Q96JB3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms