Protein–RNA interactions for Protein: Q96E17

RAB3C, Ras-related protein Rab-3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3CQ96E17 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB3CQ96E17 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB3CQ96E17 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB3CQ96E17 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB3CQ96E17 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB3CQ96E17 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB3CQ96E17 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB3CQ96E17 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB3CQ96E17 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB3CQ96E17 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB3CQ96E17 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB3CQ96E17 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB3CQ96E17 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB3CQ96E17 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB3CQ96E17 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB3CQ96E17 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB3CQ96E17 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB3CQ96E17 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB3CQ96E17 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB3CQ96E17 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB3CQ96E17 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RAB3CQ96E17 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB3CQ96E17 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB3CQ96E17 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB3CQ96E17 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB3CQ96E17 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB3CQ96E17 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB3CQ96E17 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB3CQ96E17 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB3CQ96E17 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB3CQ96E17 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB3CQ96E17 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB3CQ96E17 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB3CQ96E17 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB3CQ96E17 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB3CQ96E17 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB3CQ96E17 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB3CQ96E17 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB3CQ96E17 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB3CQ96E17 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB3CQ96E17 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB3CQ96E17 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB3CQ96E17 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAB3CQ96E17 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAB3CQ96E17 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB3CQ96E17 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB3CQ96E17 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB3CQ96E17 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB3CQ96E17 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB3CQ96E17 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB3CQ96E17 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RAB3CQ96E17 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB3CQ96E17 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB3CQ96E17 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB3CQ96E17 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB3CQ96E17 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB3CQ96E17 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB3CQ96E17 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB3CQ96E17 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB3CQ96E17 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB3CQ96E17 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB3CQ96E17 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB3CQ96E17 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB3CQ96E17 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB3CQ96E17 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB3CQ96E17 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB3CQ96E17 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB3CQ96E17 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB3CQ96E17 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB3CQ96E17 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB3CQ96E17 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB3CQ96E17 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB3CQ96E17 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB3CQ96E17 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB3CQ96E17 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB3CQ96E17 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB3CQ96E17 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB3CQ96E17 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB3CQ96E17 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB3CQ96E17 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB3CQ96E17 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB3CQ96E17 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB3CQ96E17 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB3CQ96E17 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB3CQ96E17 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB3CQ96E17 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB3CQ96E17 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB3CQ96E17 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB3CQ96E17 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB3CQ96E17 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB3CQ96E17 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB3CQ96E17 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB3CQ96E17 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB3CQ96E17 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB3CQ96E17 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB3CQ96E17 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB3CQ96E17 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB3CQ96E17 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB3CQ96E17 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB3CQ96E17 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms