Protein–RNA interactions for Protein: Q96CK0

ZNF653, Zinc finger protein 653, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF653Q96CK0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ZNF653Q96CK0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
ZNF653Q96CK0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ZNF653Q96CK0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ZNF653Q96CK0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ZNF653Q96CK0 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ZNF653Q96CK0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ZNF653Q96CK0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ZNF653Q96CK0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ZNF653Q96CK0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ZNF653Q96CK0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ZNF653Q96CK0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ZNF653Q96CK0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
ZNF653Q96CK0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ZNF653Q96CK0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ZNF653Q96CK0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ZNF653Q96CK0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ZNF653Q96CK0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ZNF653Q96CK0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ZNF653Q96CK0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ZNF653Q96CK0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ZNF653Q96CK0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ZNF653Q96CK0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ZNF653Q96CK0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ZNF653Q96CK0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ZNF653Q96CK0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
ZNF653Q96CK0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ZNF653Q96CK0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ZNF653Q96CK0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ZNF653Q96CK0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ZNF653Q96CK0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ZNF653Q96CK0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ZNF653Q96CK0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ZNF653Q96CK0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ZNF653Q96CK0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ZNF653Q96CK0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ZNF653Q96CK0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ZNF653Q96CK0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ZNF653Q96CK0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ZNF653Q96CK0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ZNF653Q96CK0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ZNF653Q96CK0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
ZNF653Q96CK0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ZNF653Q96CK0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ZNF653Q96CK0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ZNF653Q96CK0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZNF653Q96CK0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZNF653Q96CK0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
ZNF653Q96CK0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ZNF653Q96CK0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ZNF653Q96CK0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
ZNF653Q96CK0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZNF653Q96CK0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ZNF653Q96CK0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ZNF653Q96CK0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ZNF653Q96CK0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ZNF653Q96CK0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ZNF653Q96CK0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ZNF653Q96CK0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ZNF653Q96CK0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ZNF653Q96CK0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ZNF653Q96CK0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ZNF653Q96CK0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ZNF653Q96CK0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ZNF653Q96CK0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ZNF653Q96CK0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ZNF653Q96CK0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ZNF653Q96CK0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ZNF653Q96CK0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ZNF653Q96CK0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ZNF653Q96CK0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ZNF653Q96CK0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ZNF653Q96CK0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ZNF653Q96CK0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ZNF653Q96CK0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ZNF653Q96CK0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ZNF653Q96CK0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ZNF653Q96CK0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ZNF653Q96CK0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ZNF653Q96CK0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ZNF653Q96CK0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ZNF653Q96CK0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ZNF653Q96CK0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ZNF653Q96CK0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ZNF653Q96CK0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ZNF653Q96CK0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ZNF653Q96CK0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ZNF653Q96CK0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ZNF653Q96CK0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZNF653Q96CK0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZNF653Q96CK0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZNF653Q96CK0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZNF653Q96CK0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZNF653Q96CK0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZNF653Q96CK0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZNF653Q96CK0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZNF653Q96CK0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ZNF653Q96CK0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ZNF653Q96CK0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZNF653Q96CK0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms